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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001514`

染色体: Chr05 坐标: 13889456-13893742 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001514`
名称	SmilChr05G001514
描述	transcription termination factor MTERF9, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	13889456 - 13893742 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986206`
GeneID	`130986206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986206`
原始查询	`LOC130986206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF9, chloroplastic
产物	transcription termination factor MTERF9%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G55580` (AT5G55580) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835652] identity=59.7; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0583200` (OJ1127_E01.105) - identity=71.4; qcov=0.65; evalue=2.9e-173; confidence=high
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765504.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057765504.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765504.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765504.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:13891362`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:13891362`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:13891363`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:13891363`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:13891438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:13891905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,D6
`Chr5:13891907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B85,C39,D10
`Chr5:13891999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:13892029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,C16,C28,C74
`Chr5:13892029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C16,C28,C74
`Chr5:13892035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A15,B1,B100,B114,B120,B126,B131,B134,B17,B25,B30,B37,B38,B39,B4,B45,B54,B58,B64,B79,B80,B84,B88,B94,C1,C12,C13,C19,C21,C24,C31,C42,C43,C57,C6,C63,C64,C66,C67,D1,D9
`Chr5:13892132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765504.1

511 aa

256

511

mTERF

PF02536 mTERF 203-277 aa PF02536 mTERF 266-461 aa

XP_057765505.1

511 aa

256

511

mTERF

PF02536 mTERF 203-277 aa PF02536 mTERF 266-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765504.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	203	277	2.4e-48	165.4	mTERF
`XP_057765504.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	266	461	2.4e-48	165.4	mTERF
`XP_057765505.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	203	277	2.4e-48	165.4	mTERF
`XP_057765505.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	266	461	2.4e-48	165.4	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909522.1
GGTTTTCACCTTACAAAATTCATCCGACACGAGGACTAGAGTGATTGAGAACGTAAAATGGAGCGAAACCAGAGAAACTAGTAGAAGAGCATGTAAGAATACAACAAGATAAGGTTGGCATTGTACGGTCGTAGCGTTTCCTCCTTCATTCCCTAAAATCTCTCTAGGGTTTTAGAGCATACTTAGCGGCATATTCTCCTATTCTCTTCCTTCCACTCTTAAATTCAGCTAATAATGGCTGTTTTGTCCTTCTCCACTGC...

XM_057909521.1
ACCTTACAAAATTCATCCGACACGAGGACTAGAGTGATTGAGAACGTAAAATGGAGCGAAACCAGAGAAACTAGTAGAAGAGCATGTAAGAATACAACAAGATAAGGTTGGCATTGTACGGTCGTAGCGTTTCCTCCTTCATTCCCTAAAATCTCTCTAGGGTTTTAGAGCATACTTAGCGGCATATTCTCCTATTCTCTTCCTTCCACTCTTAAATTCAGCTAATAATGGCTGTTTTGTCCTTCTCCACTGCCACGCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986206
ATGGCTGTTTTGTCCTTCTCCACTGCCACGCTCAACCACCGCTCCCTCTCCCACGCCTCCTCTCTCCTCTTTCTCGCTGCCTCCCTCCTCCAATCCCCCGCTGGAAGATTCAGCTGCAGAACCCGAGTCGCCTCGTCGCATTCCAATCCCAAGATATTGAAGTCCAACCGACGCTCCAGGCACGGCCACCCGCTCTCGCCCTACGACACTGATGACGATGTGCGCGCCGCTGCTTCTGATCAACTCGACGACGGGGAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765504.1
MAVLSFSTATLNHRSLSHASSLLFLAASLLQSPAGRFSCRTRVASSHSNPKILKSNRRSRHGHPLSPYDTDDDVRAAASDQLDDGEDDWLSDDELGDVEISETDRQRLKLKSAANKGQGRTRHIGKTWGLESSSPARNLATRPRKSVAKNGIYNMEKIDGDGPLGVVSSTLNSKVKEAESSVQNRFGHLSEELDLDERYFPLLNYLSTFGLKERHFIQMYERHMPSLQINVESAEERLEYLLSVGVKHRDIQKIILRQPQ...

XP_057765505.1
MAVLSFSTATLNHRSLSHASSLLFLAASLLQSPAGRFSCRTRVASSHSNPKILKSNRRSRHGHPLSPYDTDDDVRAAASDQLDDGEDDWLSDDELGDVEISETDRQRLKLKSAANKGQGRTRHIGKTWGLESSSPARNLATRPRKSVAKNGIYNMEKIDGDGPLGVVSSTLNSKVKEAESSVQNRFGHLSEELDLDERYFPLLNYLSTFGLKERHFIQMYERHMPSLQINVESAEERLEYLLSVGVKHRDIQKIILRQPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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