当前解析结果
SmilChr05G001515| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001515 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001515 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001515 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 13898505 - 13899420 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986208 |
|---|---|
| GeneID | 130986208 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986208 |
| 原始查询 | LOC130986208 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0431500; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os08g0431500; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G16450 (AT4G16450)NADH-ubiquinone oxidoreductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827343] identity=79.2; qcov=0.99; evalue=2.63e-57; confidence=high |
| Rice | Os08g0431500- identity=84.2; qcov=0.99; evalue=8.34e-60; confidence=high |
| GO | GO:0005747 (GO:0005747) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10785 (NADH-u_ox-rdase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986208 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057765509.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057765509.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057765509.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765509.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765509.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:13898798 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B7,C11,C69,D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765509.1PF10785
NADH-u_ox-rdase 11-89 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765509.1 |
Pfam | PF10785 |
NADH-u_ox-rdase | Domain | 11 | 89 | 1.1e-19 | 71.6 | NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。