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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001533`

染色体: Chr05 坐标: 14030625-14033530 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001533`
名称	SmilChr05G001533
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14030625 - 14033530 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986223`
GeneID	`130986223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986223`
原始查询	`LOC130986223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG2
产物	cytokinin riboside 5'-monophosphate phosphoribohydrolase LOG2
Arabidopsis	`AT1G50575` (AT1G50575) Putative lysine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841479] identity=70.3; qcov=0.73; evalue=1.46e-121; confidence=high
Rice	`Os03g0587100` (OSJNBa0010D22.29) - identity=71.2; qcov=0.698; evalue=6.8e-122; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03641 (Lysine_decarbox)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765548.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057765548.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765548.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765548.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14032047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D9
`Chr5:14032056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:14032292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B23,B76,C42,C53
`Chr5:14032333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B81,C62
`Chr5:14032513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B38,B39,B79
`Chr5:14032577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:14032841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:14032845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B118,B128,B129,B54,B59,B80,B87,C15,C19,C27,C34,C53,C75,D4
`Chr5:14033118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B97,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765548.1

318 aa

159

318

Lysine_decarbox

PF03641 Lysine_decarbox 134-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765548.1`	Pfam	`PF03641`	Lysine_decarbox	Family	134	280	9.3e-24	84.8	Possible lysine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909565.1
ATGACCGGCGTATCCCTGACTAACTTGCGCACAGTCTACTTCACCCTTGTGTTGGGCAAGAATCGAAGCATCTGCACCTTGAGCAAATCGACCAAACGAACCTCGTTCCATTTCTTTCTCCCCAAAACTTTTAATTCTGATGTTGCTATTACATTACAGTACATTGATGCCAACTGAAAAATCATCGACTCTCTGAAAAATGGGTTTTTCAGTATCTAGTTCGAGTTCATTGTGGCTCAACGTGAATCCTCCGCGGCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986223
ATGGGTTTTTCAGTATCTAGTTCGAGTTCATTGTGGCTCAACGTGAATCCTCCGCGGCGATGTCGTTTTACGAAAATTCCCTCTGTTGCCGGAAATCGGAAGCGCACGGCGAGTTTGAAGATCACTGAGATTTATAGGAAAGCTCAAACTCAATCACCAAGGCCTGTTTGCTGCAAGTTTGAGGGCATTGATTTTGAGGAGAGAACCAGCCCTGCTGAGGTGAAGAGAGAAATTGAGAACTGCTATGAGCTTATACGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765548.1
MGFSVSSSSSLWLNVNPPRRCRFTKIPSVAGNRKRTASLKITEIYRKAQTQSPRPVCCKFEGIDFEERTSPAEVKREIENCYELIRRLGRGVVYLGSARLGPGHPHFVRSFQLAKGIANLLDCATWSGAGPGLMDAVTKGALEAGKPVGGFKIGKEAGQWTATDVHPYLPLDSYLTCRFFSARKHGLVDAGVRAVSSEKTAFVALPGGIGTLDEAFEILALIQLQRIGSVLPVPFLVMNYDSFYSKLLDFIDDCEGWGTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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