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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001537`

染色体: Chr05 坐标: 14049376-14050887 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001537`
名称	SmilChr05G001537
描述	pirin-like protein
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14049376 - 14050887 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986229`
GeneID	`130986229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986229`
原始查询	`LOC130986229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pirin-like protein
产物	pirin-like protein
Arabidopsis	`AT1G50590` (AT1G50590) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841481] identity=65.3; qcov=0.964; evalue=1.93e-141; confidence=high
Rice	`Os09g0484800` - identity=68.6; qcov=0.932; evalue=3.78e-149; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02678 (Pirin); PF05726 (Pirin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765552.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765552.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765552.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765552.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14049934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:14050056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C60,D4
`Chr5:14050724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B3,B85,B86
`Chr5:14050777`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A1,A11,A18,A2,A20,A23,A3,A6,A7,A8,B1,B10,B109,B11,B114,B122,B125,B126,B127,B132,B138,B14,B22,B3,B34,B35,B41,B46,B51,B52,B54,B55,B60,B65,B67,B72,B77,B78,B81,B9,B91,B99,C11,C19,C20,C24,C26,C31,C32,C33,C35,C38,C40,C41,C42,C45,C47,C49,C50,C51,C55,C56,C65,C68,C69,C70,C73,C74,C87,C9,D3,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765552.1

308 aa

154

308

Pirin

Pirin_C

PF02678 Pirin 42-136 aa PF05726 Pirin_C 190-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765552.1`	Pfam	`PF02678`	Pirin	Family	42	136	2.3e-32	111.9	Pirin
`XP_057765552.1`	Pfam	`PF05726`	Pirin_C	Domain	190	291	5e-35	120.7	Pirin C-terminal cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909569.1
TCCCCTGGGCCCCGCCCCGCCCCAAAATCAACTAACGGAATTAACTTGGCCTGCACCTATATCCTATATATACCCCGATGCATGAATTCTTCATATTCAAAATTTCATATCGCAATCCACAAAAGTATATTGAAATCAACATGTCTCGTCCCGTCGTCAGAAAGTTCCTGGCTCGGCCTCAGCACGAAGGCGTCGGCGCCACCGTTAGAAGAAGCATTGGAAGGTTTGAGCTGAAATACTTCGACCCTTTTCTTGTTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986229
ATGCATGAATTCTTCATATTCAAAATTTCATATCGCAATCCACAAAAGTATATTGAAATCAACATGTCTCGTCCCGTCGTCAGAAAGTTCCTGGCTCGGCCTCAGCACGAAGGCGTCGGCGCCACCGTTAGAAGAAGCATTGGAAGGTTTGAGCTGAAATACTTCGACCCTTTTCTTGTTCTGGACGAGTTCTCAGTTTCTGCGCCGGCTGGATTTCCTGATCACCCACACAGAGGATTCGAGACCGTCACCTACATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765552.1
MHEFFIFKISYRNPQKYIEINMSRPVVRKFLARPQHEGVGATVRRSIGRFELKYFDPFLVLDEFSVSAPAGFPDHPHRGFETVTYMLQGAVRHEDFEGHKGTIEAGDLQWMTAGRGIVHSEMPAAEGTQKGLQLWINLSSKHKMIEPRYQEMKSREIAEASRDGVQVRVIAGEALGVKSEIYTTTPTMFLDFTLKPGAHIRQPIPTSWNAFVYVLEGEATFSNSPVSAHHLLLLGEGHAVYASNHSSKPLRFILVGGQPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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