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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001545`

染色体: Chr05 坐标: 14144792-14148924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001545`
名称	SmilChr05G001545
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP-X isozyme 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14144792 - 14148924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986238`
GeneID	`130986238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986238`
原始查询	`LOC130986238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP-X isozyme 2
产物	serine/threonine-protein phosphatase PP-X isozyme 2
Arabidopsis	`AT5G55260` (PPX2) protein phosphatase X 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835619] identity=94.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0284200` (OsPP106) - identity=93.8; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765567.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765567.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765567.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057765567.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14145203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B35,B47,C71
`Chr5:14147147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:14147172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:14148112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:14148231`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	156	A11,A13,A16,A18,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B138,B14,B140,B17,B19,B2,B21,B22,B25,B26,B29,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B42,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B58,B6,B61,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B8,B82,B83,B84,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C11,C12,C13,C17,C18,C2,C22,C23,C25,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C36,C38,C4,C41,C44,C45,C46,C47,C48,C51,C54,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C7,C70,C72,C75,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D5,D6,D8
`Chr5:14148233`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	157	A11,A13,A16,A18,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B138,B14,B140,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B29,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B42,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B58,B6,B61,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B8,B82,B83,B84,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C11,C12,C13,C17,C18,C2,C22,C23,C25,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C36,C38,C4,C41,C44,C45,C46,C47,C48,C51,C54,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C67,C68,C7,C70,C72,C75,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D5,D6,D8
`Chr5:14148256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C23,D11
`Chr5:14148431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765567.1

305 aa

152

305

Metallophos

PF00149 Metallophos 45-239 aa

XP_057765568.1

305 aa

152

305

Metallophos

PF00149 Metallophos 45-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765567.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	45	239	8.4e-49	167.4	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057765568.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	45	239	8.4e-49	167.4	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909585.1
AAAGAAACCAACCAAACCACCAAAAAATGTTCAAAGTTTGTTGAGCCTTGTTAGCACGTGATATACAATAGTACTATTGCGGAACTATATGGCCTTAAATTTTAATTAGAGCAGAAACTGAGGGGAGAACTCTAATTTCTGATAATTTTGATCGCGAGTCGCGAAACCCCATTTCTATCAGAGCAGTGAGAAAAAGGAAGCCCGCACAAAAAAGAAAGAGCAGAAGAGGGGTTAGGAAGTGGTGGTAATCTTAGGCGGAG...

XM_057909584.1
TAAATTTTAATTAGAGCAGAAACTGAGGGGAGAACTCTAATTTCTGATAATTTTGATCGCGAGTCGCGAAACCCCATTTCTATCAGAGCAGTGAGAAAAAGGAAGCCCGCACAAAAAAGGTAGCTAACCTCAGCTGTTATCAGCTCCAGCAGTTTAAAATTAGGTCGTCAACGATATTTGGATGCAGAATACTTTTGATAATTCGAAGTGGATTTGATTTGATTCGATTTGGTGGCAGAAAGAGCAGAAGAGGGGTTAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986238
ATGTCTGACCTAGACCGGCAAATCGAGCAGCTCAAGAGATGCGAACCGCTCACAGAATCTGAGGTGAAGGCCCTTTGCCTCAAAGCAATGGAAATCCTCGTTGAAGAGAGCAATGTTCAGCGCGTAGATGCACCAGTCACTATCTGTGGTGACATACATGGGCAATTCTATGACATGAAACAACTTTTTAGAGTAGGTGGTGATTGTCCAAAGACAAATTACTTGTTTCTTGGAGATTTTGTTGATAGAGGATTTTACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765567.1
MSDLDRQIEQLKRCEPLTESEVKALCLKAMEILVEESNVQRVDAPVTICGDIHGQFYDMKQLFRVGGDCPKTNYLFLGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVNVWRYCTDIFDYLSLSALIENRIFCVHGGLSPAISTLDQIRVIDRKQEVPHDGAMCDLLWSDPEDIVDGWGLSPRGAGFLFGGSVVSSFNHTNNIDYICRAHQLVMEGYKWMFNNQIVTVWSAPNY...

XP_057765568.1
MSDLDRQIEQLKRCEPLTESEVKALCLKAMEILVEESNVQRVDAPVTICGDIHGQFYDMKQLFRVGGDCPKTNYLFLGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVNVWRYCTDIFDYLSLSALIENRIFCVHGGLSPAISTLDQIRVIDRKQEVPHDGAMCDLLWSDPEDIVDGWGLSPRGAGFLFGGSVVSSFNHTNNIDYICRAHQLVMEGYKWMFNNQIVTVWSAPNY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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