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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001549`

染色体: Chr05 坐标: 14218385-14220254 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001549`
名称	SmilChr05G001549
描述	indole-3-acetate O-methyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14218385 - 14220254 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986240`
GeneID	`130986240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986240`
原始查询	`LOC130986240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	indole-3-acetate O-methyltransferase 1
产物	indole-3-acetate O-methyltransferase 1
Arabidopsis	`AT5G55250` (IAMT1) IAA carboxylmethyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835618] identity=69.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0665200` (IAMT1) - identity=61; qcov=1.02; evalue=1.28e-177; confidence=high
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765572.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765572.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765572.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765572.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14218546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr5:14218563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:14218720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A2,B44,B55,C60
`Chr5:14219004`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A1,A10,A11,A2,A3,A6,B100,B101,B109,B11,B114,B122,B140,B46,B54,B67,B99,C19,C26,C35,C41,C47,C53,C55,C60,C85,C87,C9,D11,D8
`Chr5:14219336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B47,C71
`Chr5:14219342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B76,B82,C23,C70
`Chr5:14219753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B117,B140,B46,D8
`Chr5:14219812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr5:14219834`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A13,A21,B1,B113,B25,B34,B37,B68,B9,B98,C33,C67,C86,D9
`Chr5:14219896`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	101	A10,A13,A22,A23,A4,A5,B107,B108,B11,B112,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B125,B127,B130,B131,B132,B136,B138,B139,B15,B18,B2,B20,B23,B24,B29,B3,B34,B38,B40,B47,B48,B51,B52,B54,B57,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B69,B70,B73,B77,B79,B81,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B98,B99,C11,C15,C16,C23,C27,C29,C3,C35,C36,C37,C39,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C54,C55,C56,C60,C63,C66,C7,C72,C75,C78,C81,C82,C87,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr5:14219906`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A10,A13,A22,A23,A24,A4,A5,B103,B107,B108,B11,B112,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B125,B127,B130,B131,B132,B138,B15,B18,B2,B20,B23,B24,B29,B3,B33,B34,B38,B40,B47,B48,B51,B52,B54,B57,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B69,B70,B73,B77,B79,B81,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B99,C15,C16,C23,C27,C29,C3,C35,C36,C37,C39,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C54,C55,C56,C60,C63,C66,C7,C72,C75,C78,C81,C82,C87,D1,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr5:14219913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B29,B3,B58,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765572.1

386 aa

193

386

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 17-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765572.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	17	381	2.7e-110	369.5	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909589.1
CCGACAGTGAATTTTGATCCCTATCCACTCTCACTCTCCCTAGCTATATATACCCCACTTCACTCCCCAACTCTAATCATCTCATCATATCATATCCTTCCTTCATTGCTGAAAACACAATCTACTCTCATGGCTCCCACTGCTGAAAATGTTGTAGTTTCCAACAAAAAGCTTGAGCGAATGCTGAGCATGAAAGGTGGCAAAGGCGAAGCTAGCTACGTCAACAACTCTCAAGCTCAGGCGCAGCATGCGCGGTCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986240
ATGGCTCCCACTGCTGAAAATGTTGTAGTTTCCAACAAAAAGCTTGAGCGAATGCTGAGCATGAAAGGTGGCAAAGGCGAAGCTAGCTACGTCAACAACTCTCAAGCTCAGGCGCAGCATGCGCGGTCGATGCTCCACCTGCTGAGAGAAACCCTGGACGGCGTGCGGCTGAGAGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGGCCTTCGTGGTGGCGGACCTGGGATGCTCGTGCGGGAGCAACACCATATACATGGTGGAGTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765572.1
MAPTAENVVVSNKKLERMLSMKGGKGEASYVNNSQAQAQHARSMLHLLRETLDGVRLRAAAEEEEAFVVADLGCSCGSNTIYMVEFIIKHMMKRHEEAGRQPPEFSAFFSDLPSNDFNMLFQLLPPYGGLSMEECLASDTHRSYFAAGVPGTFYRRLFPANSVDVFYSAFSLHWLSQVPDVVLDKRSTAYNKGRIFIHGANESTANAYKKQFQSDLGGFLRSRAKEIKTGGSMFLVCLGRTCSDPTDQGGAGLLFGTHFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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