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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001580`

染色体: Chr05 坐标: 14510681-14512590 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001580`
名称	SmilChr05G001580
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14510681 - 14512590 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986263`
GeneID	`130986263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986263`
原始查询	`LOC130986263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT2G41640` (AT2G41640) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818762] identity=34.4; qcov=0.838; evalue=4.25e-71; confidence=low
Rice	`Os02g0135500` (P0585B01.29-1) - identity=35.7; qcov=0.801; evalue=3.9e-77; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765599.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765599.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765599.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14511125`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A5,B100,B101,B108,B109,B110,B113,B118,B123,B136,B36,B48,B53,B64,B7,B74,B80,B94,C33,C34,C49,C53,C58,C61,C70,C80,C84,D11,D3,D6,D7,D9
`Chr5:14511283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B49
`Chr5:14511383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B94,D10
`Chr5:14511404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B58,B76,C3
`Chr5:14511422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:14511483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B13
`Chr5:14511491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B13
`Chr5:14511519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:14511727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:14511868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:14512068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B76,C3,C53
`Chr5:14512071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B49,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765599.1

458 aa

229

458

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 245-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765599.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	245	360	8.2e-12	46.3	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909616.1
GACTGATCATATGATAGAAGGACAAAAATTATAAAAAATTCATGTGGAGAGAATGACAGGTTAATTAAGGGAAACGAAAGCTTAAAAACTTAATCCCACCACAGTTTTAGTCTTCAACAATCTCCAGCTTCATCATCATCATCATCATCTACATATATTATTCGTCTTTTACACGTAACATGCAACAGCTATGAAGATGGAGAAAGATCAGAAGAAGCTAGTTTTTGGTGCCACTCCATTCATTTTACTACTTTCCTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986263
ATGAAGATGGAGAAAGATCAGAAGAAGCTAGTTTTTGGTGCCACTCCATTCATTTTACTACTTTCCTTGCCTTTGCTCTGTGTTGGTGTCGATTTCGTCTGGGGGAATAGAATTTCCTTGGATCAATGGATGCAGTATTTTTCCAGCTCAGAATCTGGCGGAAAGACTGTGGAAGACAAGGAATTCATCAATTTCCATTTGGCAAGACTAGTGCGAGGGGAGGACAGGAGGAAGCTTGACGACACAGGCTTCGCCTGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765599.1
MKMEKDQKKLVFGATPFILLLSLPLLCVGVDFVWGNRISLDQWMQYFSSSESGGKTVEDKEFINFHLARLVRGEDRRKLDDTGFACDKAIHSIHCVSTKPVRIDTRNMTVYIPSDADWQQETAIRPYARQEDELKQISAVRMIQYSNTTDPPPCEFSHHVPAVVFSSGSTGNVFHEMNEIIIPLYITTKQFQSRVVFVIEDYKPSFIAKYGAVLAHLSAHEAMNPAANATVHCFPASIVGLKYHDNLALNSSDIPGGYGM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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