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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001599`

染色体: Chr05 坐标: 14718376-14722378 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001599`
名称	SmilChr05G001599
描述	SEC12-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14718376 - 14722378 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986281`
GeneID	`130986281`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986281`
原始查询	`LOC130986281`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SEC12-like protein 2
产物	SEC12-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G01470` (STL2P) SEC12P-like 2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814675] identity=48.3; qcov=1.04; evalue=1.32e-111; confidence=high
Rice	`Os11g0610700` (OsWD40-190) - identity=47.1; qcov=1.02; evalue=1.06e-113; confidence=high
GO	GO:0003400 (GO:0003400); GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0009306 (protein secretion)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986281

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057765624.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057765624.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765624.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765624.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14719286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A14,A15,A20,A24,A8,B100,B102,B12,B122,B123,B135,B139,B16,B18,B25,B38,B45,B46,B47,B48,B50,B54,B56,B6,B73,B74,B79,B84,B89,B96,C20,C21,C23,C27,C28,C3,C35,C36,C38,C44,C64,C66,C70,C71,C73,C80,C84,C87,D10,D11,D6,D9
`Chr5:14719841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr5:14719881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14721426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr5:14721431`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A14,B1,B100,B129,B47,B58,B61,B74,C24,C35,C36,C38,C4,C70,C71,C87
`Chr5:14721432`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A14,B1,B100,B129,B47,B58,B61,B74,C24,C35,C36,C38,C4,C70,C71,C87
`Chr5:14721654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C36,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765624.1

378 aa

189

378

WD40

PF00400 WD40 142-164 aa PF00400 WD40 177-198 aa PF00400 WD40 310-336 aa

XP_057765626.1

377 aa

188

377

WD40

PF00400 WD40 142-164 aa PF00400 WD40 177-198 aa PF00400 WD40 310-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765624.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	142	164	3.8e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765624.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	177	198	3.8e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765624.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	310	336	3.8e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765626.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	142	164	4e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765626.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	177	198	4e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057765626.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	310	336	4e-15	56.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909641.1
GGGATCACATTCACATTCACAGCGGAGCAAGAAAGCATGGGCAGCGAGAATGACGAAGAATTGAACTGCAAGAAGTATGGAGTCCCGCTTTACGGCGCCGCCTGGGTTCCATCTGCTGCCTTTACCGCCAACGAGTTGGAAACTCCTGCCAAACGCCTCGTTGTCCTAGCCGGAGGCGGCGGAGAAGGCCACAGCGGGATTCCAAATGCCCTCCTCCTCTCGGCCTTTGATTCCGAATCCTGCTCCCTCTCTGATCAGCC...

XM_057909643.1
GATCACATTCACATTCACAGCGGAGCAAGAAAGCATGGGCAGCGAGAATGACGAAGAATTGAACTGCAAGAAGTATGGAGTCCCGCTTTACGGCGCCGCCTGGGTTCCATCTGCTGCCTTTACCGCCAACGAGTTGGAAACTCCTGCCAAACGCCTCGTTGTCCTAGCCGGAGGCGGCGGAGAAGGCCACAGCGGGATTCCAAATGCCCTCCTCCTCTCGGCCTTTGATTCCGAATCCTGCTCCCTCTCTGATCAGCCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986281
ATGGGCAGCGAGAATGACGAAGAATTGAACTGCAAGAAGTATGGAGTCCCGCTTTACGGCGCCGCCTGGGTTCCATCTGCTGCCTTTACCGCCAACGAGTTGGAAACTCCTGCCAAACGCCTCGTTGTCCTAGCCGGAGGCGGCGGAGAAGGCCACAGCGGGATTCCAAATGCCCTCCTCCTCTCGGCCTTTGATTCCGAATCCTGCTCCCTCTCTGATCAGCCTGTGGCTAAGCTTGGAACTGGTAGCGATCTGCCTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765624.1
MGSENDEELNCKKYGVPLYGAAWVPSAAFTANELETPAKRLVVLAGGGGEGHSGIPNALLLSAFDSESCSLSDQPVAKLGTGSDLPYRIGVHPGGEGIMCSFPQNCRWFEWDSATSTDDQTLSLKSSEKVLKPLEDVGQQLALTFNTEGNLLAVGGEDGKLRVFKWPAMESILSEANAHSSVKDLDFSPDGKFLVSVGSGPGRIWDVSSSSSSVASLPKENDEIFGFCRFSRSTGTDQVLYITTMRDKGGSIVKWNPTSW...

XP_057765626.1
MGSENDEELNCKKYGVPLYGAAWVPSAAFTANELETPAKRLVVLAGGGGEGHSGIPNALLLSAFDSESCSLSDQPVAKLGTGSDLPYRIGVHPGGEGIMCSFPQNCRWFEWDSATSTDDQTLSLKSSEKVLKPLEDVGQQLALTFNTEGNLLAVGGEDGKLRVFKWPAMESILSEANAHSSVKDLDFSPDGKFLVSVGSGPGRIWDVSSSSSSVASLPKENDEIFGFCRFSRSTGTDQVLYITTMRDKGGSIVKWNPTSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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