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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001609`

染色体: Chr05 坐标: 14820692-14821777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001609`
名称	SmilChr05G001609
描述	uncharacterized SmilChr05G001609
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14820692 - 14821777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986291`
GeneID	`130986291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986291`
原始查询	`LOC130986291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332]; symbol=AT3G51690; hit=AT3G51690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51690` (AT3G51690) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824332] identity=40.1; qcov=0.946; evalue=3.62e-70; confidence=medium
Rice	`Os04g0206200` - identity=45; qcov=0.573; evalue=4.52e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765641.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765641.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057765641.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765641.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14820708`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B117,B18,B55,B62,B68,B69,B98,C20,C56,C67,D10
`Chr5:14820724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B78,C24
`Chr5:14820779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:14820803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C13,C27,C86
`Chr5:14820805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B98,C34,C51
`Chr5:14820807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:14820823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B48,C52
`Chr5:14820848`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B108,B121,B16,B78,B8,B98,C19,C36
`Chr5:14820910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C53,C57,D10
`Chr5:14820912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B84
`Chr5:14820923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B14,B30,B66,C83
`Chr5:14820927`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B101,B112,B129,B16,B21,B35,B41,B49,B57,C17,C21,C28,C3,C69,C79,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765641.1

295 aa

148

295

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 131-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765641.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	131	177	6.9e-21	74.4	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909658.1
AGGCAGATCTTGCCAGTTGTCCCCAATGGGAGTCGACACGACATTGTGCATGCTTCAATAAGCTCTTCTCAACTTTGGACATCATGCAAAGTTCTGAGGTTGACTAAGAATATGAGATTACAGGGAGGAGCGTCTGGATCTGATGCTGAAGACATCAAGAAATTTGCAGAATGGATACTTAGTATAGGGGATGGTACAGCTGGTGAGAGTATTGGTGATGGAGAAGCCGATTTGAGGTTACCAGACGATATGATAATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986291
ATGAGATTACAGGGAGGAGCGTCTGGATCTGATGCTGAAGACATCAAGAAATTTGCAGAATGGATACTTAGTATAGGGGATGGTACAGCTGGTGAGAGTATTGGTGATGGAGAAGCCGATTTGAGGTTACCAGACGATATGATAATACGGGATTCAAGTAATCCTATTGCATCCATAGTGAAAAGTACTTATCCAGACGTACTGCATACCCTGTCTAATCCAGAATATTTTAAGGATAGAGCTATCCTGGCCCCAACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765641.1
MRLQGGASGSDAEDIKKFAEWILSIGDGTAGESIGDGEADLRLPDDMIIRDSSNPIASIVKSTYPDVLHTLSNPEYFKDRAILAPTNDIVDSINEYVMSLMPAKERVYLSSDNICKDNGEVDLDDQVFSVEYLNTIKCSGLPSHEIKLKEGCIIMLLRNIDPSNELCNGTRMIVTKLGAHVIEAKLISGNNAGKKFSIARMIMSPSDFTKFPIRFQRRQFPLSLCFAMTINKSQGQSLANVGLYLPKPVFTYGQLYVAVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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