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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001619`

染色体: Chr05 坐标: 14961256-14966557 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001619`
名称	SmilChr05G001619
描述	THO complex subunit 5A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14961256 - 14966557 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986299`
GeneID	`130986299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986299`
原始查询	`LOC130986299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	THO complex subunit 5A
产物	THO complex subunit 5A
Arabidopsis	`AT5G42920` (THO5) THO complex, subunit 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834304] identity=56.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0767100` - identity=60.9; qcov=0.627; evalue=2.68e-180; confidence=high
GO	GO:0000445 (THO complex part of transcription export complex); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0006406 (mRNA export from nucleus); GO:0032786 (positive regulation of DNA-templated transcription, elongation)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09766 (FmiP_Thoc5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765658.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057765658.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057765659.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765658.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14961705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr5:14961782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:14962106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:14962324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:14962598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B19,C19,C41,C81
`Chr5:14962636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:14963293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:14963369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:14963434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:14963467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:14964116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B28,B74
`Chr5:14964201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765658.1

810 aa

405

810

FmiP_Thoc5

PF09766 FmiP_Thoc5 66-422 aa

XP_057765659.1

726 aa

363

726

FmiP_Thoc5

PF09766 FmiP_Thoc5 66-422 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765658.1`	Pfam	`PF09766`	FmiP_Thoc5	Family	66	422	7.3e-111	371.6	Fms-interacting protein/Thoc5
`XP_057765659.1`	Pfam	`PF09766`	FmiP_Thoc5	Family	66	422	5.6e-111	372.0	Fms-interacting protein/Thoc5

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909675.1
TAGAGGGACTCTGCCGATCTGAACGTTTGAGAGTGAGGCGAGCAAGGAGAGATAGGGAGGGAGGTCTGGCGGCGGTCGGCGACTGCTCTTGTTTGTGGGGGGAGCGCCGCCGCCGCTATTTGTGGAAGGAGCTGCGCCGCTGCTGTTTGTGGAGGGAGTCTATGGAAAATAGAGGAAGCAAGAGAGAGAGAGAGGAAGTCGAAGGAGATGGGTAATAGACGGCTGCCTCGTCGGAGGAGGAGCTGCGACAGTAAATCTTC...

XM_057909676.1
GTAGAGGGACTCTGCCGATCTGAACGTTTGAGAGTGAGGCGAGCAAGGAGAGATAGGGAGGGAGGTCTGGCGGCGGTCGGCGACTGCTCTTGTTTGTGGGGGGAGCGCCGCCGCCGCTATTTGTGGAAGGAGCTGCGCCGCTGCTGTTTGTGGAGGGAGTCTATGGAAAATAGAGGAAGCAAGAGAGAGAGAGAGGAAGTCGAAGGAGATGGGTAATAGACGGCTGCCTCGTCGGAGGAGGAGCTGCGACAGTAAATCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986299
ATGGAAGTGACAATGGCGGAGCCCGGCGAAATACTGCCGGAGCGCAACGTCGACATGGAGGCCCTCTATGATATGCTGCGGCAGAGCAAGGGTTCTACCGAGGAAATCGTCGCCAAAATTCTGGAAGTTAAAAAAGAAGCTCAACCGAAATCCCAGCTCCGAGAACTTATTACGCAGACCCTCCTTAATTTTGTTACTCTACGTCAGGCTAATAGGTCCATCTTGCTTGAAGAAGACCGGGTTAAAGCGGAATCTGAACG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765658.1
MEVTMAEPGEILPERNVDMEALYDMLRQSKGSTEEIVAKILEVKKEAQPKSQLRELITQTLLNFVTLRQANRSILLEEDRVKAESERAKAPVDLTTLQLHNLMYEKNHYVKAIKACKDFKTKYPDIELVPEEEFFRDAPEEIKSPVLSTDSAHNLMLKRLNYELSQRKELCRLREKLELQKKALQETIANRKKFLLSLPSHLKALKKASLPVQNQLGVLHTKKLKQLQLAELLPPPLYVIYSQLLAQKEAFEENIELEIT...

XP_057765659.1
MEVTMAEPGEILPERNVDMEALYDMLRQSKGSTEEIVAKILEVKKEAQPKSQLRELITQTLLNFVTLRQANRSILLEEDRVKAESERAKAPVDLTTLQLHNLMYEKNHYVKAIKACKDFKTKYPDIELVPEEEFFRDAPEEIKSPVLSTDSAHNLMLKRLNYELSQRKELCRLREKLELQKKALQETIANRKKFLLSLPSHLKALKKASLPVQNQLGVLHTKKLKQLQLAELLPPPLYVIYSQLLAQKEAFEENIELEIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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