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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001634`

染色体: Chr05 坐标: 15277728-15278583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001634`
名称	SmilChr05G001634
描述	nudix hydrolase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15277728 - 15278583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986312`
GeneID	`130986312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986312`
原始查询	`LOC130986312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 1-like
产物	nudix hydrolase 1-like
Arabidopsis	`AT1G68760` (NUDX1) nudix hydrolase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843207] identity=65.4; qcov=0.855; evalue=4.45e-65; confidence=high
Rice	`Os09g0553300` - identity=44.1; qcov=0.371; evalue=1.53e-06; confidence=low
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006203 (dGTP catabolic process); GO:0035539 (8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosine triphosphate pyrophosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765672.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057765672.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765672.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765672.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15277945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,B80
`Chr5:15278323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr5:15278451`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B132,B137,B54,C40,C70,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765672.1

159 aa

159

NUDIX

PF00293 NUDIX 9-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765672.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	9	124	2e-20	73.9	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909689.1
TGGGACAGGTGTTTAGGTGGGAAGTAACTTCAAGTTACTATTACTTGCTTAGGCCCAAAGATTCTACAAACGACGGCGGGAAATAAACTAATATTTGGCGGGAGTGGTTGCGCACTTTATTGAAACAAAACATTACGAATTCCACTACTCCTAAATTTCTTTGTTTTGCAGAAAATAGGGCGATGGAAGACGAGGCGACGAGGCCTAAAGTGGCGGTGGTGGTGTTTCTGCTGAAAGATAGAAAGGTCCTCTTAGGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986312
ATGGAAGACGAGGCGACGAGGCCTAAAGTGGCGGTGGTGGTGTTTCTGCTGAAAGATAGAAAGGTCCTCTTAGGGCGGCGCCGCTCTTCCGTCGGCCGCGACACCTTCCCTTTGCCCGGCGGCCACCTTGAGTTCGGGGAAAGCTTCGCGGGATGTGCGGCGAGAGAGGTGAAGGAGGAGACGGGACTAGACATAGAAAAGATCGAATTCCTAACGGCGACCAACAACGTCGTAACCGAGGTTCACAAACCTCTGCACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765672.1
MEDEATRPKVAVVVFLLKDRKVLLGRRRSSVGRDTFPLPGGHLEFGESFAGCAAREVKEETGLDIEKIEFLTATNNVVTEVHKPLHIVAIMMRAVLADPDQTPQNLEPEKCEGWDWYDWNDLPRPLFGPLEAMARGGFDPFSRQFSETSAYCIDFSAGI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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