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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001636`

染色体: Chr05 坐标: 15288053-15289353 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001636`
名称	SmilChr05G001636
描述	protein MIZU-KUSSEI 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15288053 - 15289353 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986313`
GeneID	`130986313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986313`
原始查询	`LOC130986313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MIZU-KUSSEI 1-like
产物	protein MIZU-KUSSEI 1-like
Arabidopsis	`AT3G25640` (AT3G25640) MIZU-KUSSEI-like protein (Protein of unknown function, DUF617) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822151] identity=52; qcov=1.15; evalue=9.91e-85; confidence=high
Rice	`Os05g0577100` - identity=48.3; qcov=1.26; evalue=7.44e-81; confidence=high
GO	GO:0010274 (hydrotropism)
KEGG	-
Pfam	PF04759 (DUF617)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765673.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057765673.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765673.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765673.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15288533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B104
`Chr5:15288563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:15288587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B104
`Chr5:15288629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:15288650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B58,B71,C74,D7
`Chr5:15288660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A21,B40,B43,C74
`Chr5:15288660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B40,B43,C74
`Chr5:15288685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr5:15288690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A18,B102,B124,B126,B18,B21,B30,B35,B90,B91,C1,C14,C21,C25,C26,C30,C38,C73,C8,C86,C87,D2
`Chr5:15288761`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B16
`Chr5:15288761`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B16
`Chr5:15288957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C28,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765673.1

238 aa

119

238

DUF617

PF04759 DUF617 87-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765673.1`	Pfam	`PF04759`	DUF617	Family	87	237	2.1e-69	233.4	Protein of unknown function, DUF617

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909690.1
TCTGTACATTCTCAATATCTCATGTTTTCCCGATTCAGTTTGGTGGGGCTGATCACCTTCTTTTTGTCAGAATTCTCCCTCTCACCACCAAAATCACCCCACCATAAAGCACATTTAAATAAGACAACATATAATTAGATCAAAACATATTCTAGCAATCACAACCCTTTGCTTCCTTTTATTTTTATTTTCACATTAAAGATTGTTTCTAGCTAGCTATCTTTCAAGACAAAAAGAAGCCATCTTTCCTTTAATTTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986313
ATGAAATCAATCATGGCTAAAACCCCTCAAGACTCATTCTCATTCTCCCGCAGATACTTCCTCTGGAAAAAGAAGGGAGCCGAAGATGAAGACAACGAAATGGAAGATATCTTGAATTTGAGCGACGAGAGAGACAAGATTTTCCCAATGCAGCAATCTGGGCGGAAAAAGATATCAGTGGTCGCCATCTCGAAGCTGCGCGCGGCCCTCGCACTGGGGCGGGCCCGGGCGCCGTTCTCGTCGGGCCTGGGGGCCCGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765673.1
MKSIMAKTPQDSFSFSRRYFLWKKKGAEDEDNEMEDILNLSDERDKIFPMQQSGRKKISVVAISKLRAALALGRARAPFSSGLGARVVGTLFGQRRGHVRFAFQEDFKVAPAFLVELATPTSALVKEMASGLVRIALECEKRAEKKGAKLLEEPVWRTYCNGKKCGYAMRRECGPDDWKVLNAVGPISMGAGVLPDGDMMYMRAKFERVVGSKDSEAFYMMNPDGNGGPELSIYLLRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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