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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001645`

染色体: Chr05 坐标: 15418457-15421249 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001645`
名称	SmilChr05G001645
描述	uncharacterized SmilChr05G001645
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15418457 - 15421249 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986321`
GeneID	`130986321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986321`
原始查询	`LOC130986321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coiled-coil protein (DUF572) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839146]; symbol=AT1G25682; hit=AT1G25682; species=arabidopsis; confidence=high
产物	coiled-coil protein (DUF572) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839146]; symbol=AT1G25682; hit=AT1G25682; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G25682` (AT1G25682) coiled-coil protein (DUF572) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839146] identity=73.4; qcov=1; evalue=1.24e-168; confidence=high
Rice	`Os02g0324300` - identity=76.4; qcov=0.957; evalue=1.83e-167; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005684 (U2-type spliceosomal complex); GO:0071014 (post-mRNA release spliceosomal complex)
KEGG	-
Pfam	PF04502 (Saf4_Yju2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765684.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057765684.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765684.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765684.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15419317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr5:15420210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C23
`Chr5:15420292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:15420307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr5:15420452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C23
`Chr5:15420464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:15420688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B19,C19,C41,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765684.1

305 aa

152

305

Saf4_Yju2

PF04502 Saf4_Yju2 13-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765684.1`	Pfam	`PF04502`	Saf4_Yju2	Family	13	275	3.6e-63	214.9	Saf4/Yju2 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909701.1
ATTTGCCTGCACGATAAACTTCTAGGGAATATAAATGTAACATCATTTGATTCAGAACTCTTATCAAAATCAACCAAAGCATAAGGAGGGCTCGGCTAAAATCATCAAATTCCTTTCGACGAGATAATCAAATCAAGATGTCTACTCTTGCAGCAGCTCGGGCAGATAACTTTTACTACCCACCGGAATGGGAGCCAAAGAAGGGTGGGTTGAACAAGTTCAATGGTCAGCATGCTTTGAGGGAGAGAGCAAGAAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986321
ATGTCTACTCTTGCAGCAGCTCGGGCAGATAACTTTTACTACCCACCGGAATGGGAGCCAAAGAAGGGTGGGTTGAACAAGTTCAATGGTCAGCATGCTTTGAGGGAGAGAGCAAGAAAAATAGATCAAGGCATCTTGATTATAAGGTTCGAGATGCCTTATAATATTTGGTGTGGTGGTTGTGAGTCCATGATTGCAAAAGGTGTAAGGTTCAATGCAGAGAAAAAGCAAGTGGGGAATTACTACTCTACAAAGATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765684.1
MSTLAAARADNFYYPPEWEPKKGGLNKFNGQHALRERARKIDQGILIIRFEMPYNIWCGGCESMIAKGVRFNAEKKQVGNYYSTKIWSFSMKSPCCKHEIVIQTDPQNCAYVIMSGARKKVEEYDAEDAETLALPVDDDKSKLADPFKRLEHQEGDIKKKKEAEPVLVRLQRISDSRHLDDYALNKSLHARLRDQKKRVAEEEASARKSGFGIRLLPSSEEDAASAKRIKFAAKFEKNRKDKRALIHAASIFSGSSSSAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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