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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001649`

染色体: Chr05 坐标: 15483358-15488300 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001649`
名称	SmilChr05G001649
描述	uncharacterized SmilChr05G001649
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15483358 - 15488300 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986325`
GeneID	`130986325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986325`
原始查询	`LOC130986325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843214]; symbol=AT1G68820; hit=AT1G68820; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843214]; symbol=AT1G68820; hit=AT1G68820; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G68820` (AT1G68820) Transmembrane Fragile-X-F-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843214] identity=70.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0706900` (OsRHC1) - identity=61.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10269 (Tmemb_185A); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057765688.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057765688.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057765688.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057765688.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057765688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15483650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B91,C44
`Chr5:15483714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B28,B36,B37
`Chr5:15483717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A10,A9,B100,B102,B107,B108,B120,B124,B128,B15,B17,B18,B19,B21,B23,B27,B31,B41,B48,B52,B53,B64,B68,B75,B9,C11,C13,C17,C18,C19,C36,C41,C46,C5,C55,C58,C68,C72,C74,C78,D4,D6
`Chr5:15486745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B71,C62
`Chr5:15486911`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr5:15486911`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr5:15486949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B24,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765688.1

461 aa

230

461

Tmemb_185A

zf-C3HC4_3

PF10269 Tmemb_185A 29-288 aa PF13920 zf-C3HC4_3 411-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765688.1`	Pfam	`PF10269`	Tmemb_185A	Family	29	288	4.1e-95	319.0	Transmembrane Fragile-X-F protein
`XP_057765688.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	411	453	6.1e-12	45.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909705.1
AGCGACATTTCCTCCGTAATAAAAATAATAAATGAAAAAGCAAAAGCGACATTCGCCTGAAAATCCAAAGACCTCCTCAGCAATTTACGTTGTAGTCTGAATAATAGATTTCCTTTTTCCCGTTCAAGTTTCAACTTTTTTTTTTTCATGGATAGATTGTATACAAACATAGACTCAGTGTAATTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGTCAATTAGTTTTTTGGTGCATAGAATTTTGGTTTGGGGAGATGATGAGCTGGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986325
ATGATGAGCTGGAGGAGAGTTTTCAAGTCTTTTCAAGTGGTGGTGGCTCATGGGTTGCTTTTCTCCTTCTCTCTTATTCTCTCTCTCAAGCTCGATCATGCTGTCAACTACTCTTGGTGGTTGGTTTTTTCTCCTATCTGGTTATTTCATGCAGTTGTGGCAAGAGGCAGATTCTCCCTACCTGCCCCATCTATGCCTCACGGTCGCAATTGGGCGCCTTTTCATGCCATTGTGGCGGCTCCTTTGCTTATTGCTTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765688.1
MMSWRRVFKSFQVVVAHGLLFSFSLILSLKLDHAVNYSWWLVFSPIWLFHAVVARGRFSLPAPSMPHGRNWAPFHAIVAAPLLIAFELLLCVHLQKRYAVNLKIVFLPLLALEAAILIDNIRMCRALMPGDDDNISDEAIWETLPHFWVSISMVFFIAATTFTLLKLCGDVAALGWWDLFINYGVAECFAFLICTKWYNPAIHRRSHLTAAASSSSNIRSFTWSNGVLVPPDEDNQENRMCSFQDIGGHIMKIPLIGFQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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