当前解析结果
SmilChr05G001650| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001650 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001650 |
| 描述 | small polypeptide DEVIL 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 15497196 - 15497645 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986326 |
|---|---|
| GeneID | 130986326 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986326 |
| 原始查询 | LOC130986326 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | small polypeptide DEVIL 4-like |
| 产物 | small polypeptide DEVIL 4-like |
| Arabidopsis | AT1G13245 (RTFL17)ROTUNDIFOLIA like 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837884] identity=73.8; qcov=1; evalue=7.48e-17; confidence=low |
| Rice | Os05g0549232- identity=81.5; qcov=0.643; evalue=1.84e-10; confidence=low |
| GO | GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08137 (DVL) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986326 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057765689.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057765689.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765689.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765689.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765689.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765689.1PF08137
DVL 21-39 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765689.1 |
Pfam | PF08137 |
DVL | Family | 21 | 39 | 2.4e-12 | 47.1 | DVL family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。