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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001652`

染色体: Chr05 坐标: 15576925-15581874 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001652`
名称	SmilChr05G001652
描述	receptor-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15576925 - 15581874 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986333`
GeneID	`130986333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986333`
原始查询	`LOC130986333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 4
产物	receptor-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G25570` (AT1G25570) Di-glucose binding protein with Leucine-rich repeat domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839144] identity=67; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0140400` (PLRRP) - identity=54.5; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF11721 (Malectin); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765707.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057765707.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765707.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765707.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15577671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:15577761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B27,D10
`Chr5:15577773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:15577780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B57,B90,B92
`Chr5:15577788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:15577830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:15578000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B9,C11,C28,C69
`Chr5:15578173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A10,A14,A15,A19,B102,B104,B105,B109,B111,B114,B115,B117,B121,B123,B127,B132,B133,B137,B22,B23,B26,B28,B32,B34,B36,B46,B50,B60,B65,B66,B68,B71,B72,B73,B76,B79,B81,B88,B89,B93,B94,B99,C1,C14,C15,C17,C22,C23,C26,C27,C30,C32,C34,C36,C37,C39,C41,C49,C5,C53,C57,C61,C64,C66,C70,C82,C86,C87,D4
`Chr5:15579258`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	130	A1,A11,A13,A19,A20,A23,A25,A3,A6,A7,B102,B103,B106,B108,B11,B111,B113,B115,B117,B118,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B29,B36,B37,B40,B41,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B58,B59,B60,B61,B64,B66,B70,B71,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C10,C13,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C38,C46,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C79,C80,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D4,D7,D8,D9
`Chr5:15579261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,D11
`Chr5:15579263`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	132	A1,A11,A13,A19,A20,A23,A25,A3,A6,A7,B102,B103,B106,B108,B11,B111,B113,B115,B117,B118,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B29,B36,B37,B40,B41,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B58,B59,B60,B61,B64,B66,B70,B71,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C38,C46,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C65,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C79,C80,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D11,D4,D7,D8,D9
`Chr5:15579297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765707.1

631 aa

316

631

Malectin_like

Malectin

LRR_1

PF12819 Malectin_like 27-369 aa PF11721 Malectin 256-354 aa PF00560 LRR_1 451-471 aa PF00560 LRR_1 474-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765707.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	27	369	4e-53	181.5	Malectin-like domain
`XP_057765707.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	256	354	2.2e-12	48.0	Malectin domain
`XP_057765707.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	451	471	8.9e-07	28.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057765707.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	474	494	8.9e-07	28.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909724.1
ATCCCACAACCTACAATCAAAACCCATCTCAGTCTCCATTTTCTGAATGATCTATCAATTATAAAATCAAGAATTTCTGAATAAATTGCTAAAATAAATATCGGAAAATATATTCAAAGGCTTTTCAAATCCTGTCCGCGTCACTACTACGTTTACTTCCCTTTCACCTGTTCCTCCCACTAATTGCGCCTCTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTAGACACACAGTTACCTCCTTATGTCCAAACGACAAACATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986333
ATGTCCGCCCTCTCCCTCGTCATCCTCTTCTCTCTCCTCCCCTCCCTCTCCTCCTACCCCTTCAACTACAGCGTCCACATTGACTGCGGCGGACTCGTCAATTCCAGCGACGCCTTCCACACCGCCTGGCTCTCCGACCGATTCTACTCCGGCGGTGCCACCTCCGTCGTCTCCGAACCGCTCCGCTTCCTTCACCAGCAGGAGAAGACGCTCCGCTACTTCCCCATCTCCTCCGGCAAGAAGAACTGCTACTCCATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765707.1
MSALSLVILFSLLPSLSSYPFNYSVHIDCGGLVNSSDAFHTAWLSDRFYSGGATSVVSEPLRFLHQQEKTLRYFPISSGKKNCYSIPTAAAEGRYFFRTFTVYDNFDGKAHSPSFDVSVEGTLVFSWRSPWPESVSRSGAYSDLFFYHNDSAIDVCFYSIATDPPVIGSLELTQIDPQAYTFEYANNSTNYILVNYGRFSSGSDQWGPGFSNDTDFFSRSWQSGADFRPSSVSTANGAEIKAISAIKPIANVELSPNYFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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