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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001651`

染色体: Chr05 坐标: 15556863-15558830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001651`
名称	SmilChr05G001651
描述	probable galacturonosyltransferase-like 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15556863 - 15558830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986353`
GeneID	`130986353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986353`
原始查询	`LOC130986353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase-like 3
产物	probable galacturonosyltransferase-like 3
Arabidopsis	`AT1G13250` (GATL3) galacturonosyltransferase-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837885] identity=66.5; qcov=0.967; evalue=3.27e-151; confidence=high
Rice	`Os03g0359600` - identity=63.1; qcov=0.904; evalue=1.04e-135; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF18404 (Glyco_transf_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765729.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765729.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765729.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765729.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15557473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B29,B67,C20,C51
`Chr5:15557506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B137,B54,C40
`Chr5:15557641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:15557642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:15557803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C20
`Chr5:15557887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:15557932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C51
`Chr5:15557995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B78,C72
`Chr5:15558263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr5:15558316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765729.1

333 aa

166

333

Glyco_transf_8

Glyco_transf_24

PF01501 Glyco_transf_8 52-305 aa PF18404 Glyco_transf_24 134-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765729.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	52	305	1.8e-52	179.1	Glycosyl transferase family 8
`XP_057765729.1`	Pfam	`PF18404`	Glyco_transf_24	Domain	134	233	1.7e-09	38.2	Glucosyltransferase 24

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909746.1
GGTTTATGATTTATTAATAATTTTCTATATCAGAGTAACAAAAAGATTGAATGTCTAAAATCTTCAAAAATAATAAAAATATCATGTCACTAAAAACAATAATAAAAAGGTCTGATCACATCAAGTACTATTCTAGTAGCACAAAAAGAAATTAAGAATTACATATATTAGTTCTTACAAATTATCTGTCCACATACATATATAAAATCCACATCATCTATGCAACTTTTTTCTAAGATAGAGAAACGTATGCAGCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986353
ATGAGCATGCCTCCCATTCTCCGGCTTCTGGTTCTTCTCCTGATGACACAGTCCGGCGGCGGCACGGGTGAGCCCCAATTCAAGGAGGCGCCGGCATTCCGCAACGGCAAGTCGTGCGACAAGTGGAGCGACGTGGTCCACATCGCCATGACCCTGGACTACTCGACCCCCTACCTCCGCGGCTCCATCGCCGCCGTCCTCTCCGTCCTCCAGCACTCCACCTGCCCCGAAAACACCGTCTTCCACTTCCTCTCCATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765729.1
MSMPPILRLLVLLLMTQSGGGTGEPQFKEAPAFRNGKSCDKWSDVVHIAMTLDYSTPYLRGSIAAVLSVLQHSTCPENTVFHFLSIPHHHPHLRATVGATFPYLRFHLYPFNPASVLHLISSSVRRALDQPLNYARIYLPDLLPPSLRRIIYLDSDLIVVDDIAKLWRIDLNSHVLGAPEYCHANFSHYFTPKFWSTPFFGATFRRRNPCYFNTGVMVIDLIKWRRHGFTHKLEHWMRIQKRYRIYELGSLPPFLLVFAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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