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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001699`

染色体: Chr05 坐标: 16204431-16206106 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001699`
名称	SmilChr05G001699
描述	tetraketide alpha-pyrone reductase 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16204431 - 16206106 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986355`
GeneID	`130986355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986355`
原始查询	`LOC130986355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraketide alpha-pyrone reductase 2
产物	tetraketide alpha-pyrone reductase 2
Arabidopsis	`AT1G68540` (TKPR2) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843183] identity=70.1; qcov=1; evalue=1.86e-173; confidence=high
Rice	`Os01g0127500` - identity=57.3; qcov=1.05; evalue=1.32e-138; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF02719 (Polysacc_synt_2); PF05368 (NmrA); PF07993 (NAD_binding_4); PF08659 (KR); PF13460 (NAD_binding_10); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765731.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765731.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765731.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765731.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16205629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B54,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765731.1

320 aa

160

320

Polysacc_synt_2

Epimerase

NmrA

NAD_binding_4

3Beta_HSD

GDP_Man_Dehyd

NAD_binding_10

PF08659 KR 4-129 aa PF02719 Polysacc_synt_2 5-125 aa PF01370 Epimerase 5-242 aa PF05368 NmrA 6-87 aa PF07993 NAD_binding_4 6-199 aa PF01073 3Beta_HSD 6-239 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 6-261 aa PF13460 NAD_binding_10 8-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	4	129	6.4e-06	26.9	KR domain
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF02719`	Polysacc_synt_2	Family	5	125	1e-06	28.9	Polysaccharide biosynthesis protein
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	5	242	6.7e-26	91.9	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	6	87	4.1e-07	30.6	NmrA-like family
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	6	199	7e-14	52.3	Male sterility protein
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	6	239	3.4e-15	56.5	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	6	261	5.6e-17	62.9	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057765731.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	8	131	1.8e-10	41.7	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909748.1
GTGCTCTCTTACAATAATCAATTTCTTTATTTCATTTAATAAACAACATAAACTACTATAAATCCTACGTTAATTATAATGTCTTGTACAAGATTGAGGTGAAGATGCCGGAGTACTGTGTAACTGGAGGAACTGGACTCATTGCAGCTTACTTGATCAAATCTCTGCTGGAAAAGGGTCATATAGTAAGGACTACTGCTCGAGATCCAGAAAACATAGAGAAAGTAGGGTATCTCCTGCAGCTGAATGGAGCTAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986355
ATGCCGGAGTACTGTGTAACTGGAGGAACTGGACTCATTGCAGCTTACTTGATCAAATCTCTGCTGGAAAAGGGTCATATAGTAAGGACTACTGCTCGAGATCCAGAAAACATAGAGAAAGTAGGGTATCTCCTGCAGCTGAATGGAGCTAAAGAAAGGCTCAAGATCATGAGAGCTGATTTGGTGGAGGAAGGGAGCTTCGACGCCGCCGTGGAGGGAGTTGACGGCGTGTTCCACGTGGCGTCTCCGGTGCTCGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765731.1
MPEYCVTGGTGLIAAYLIKSLLEKGHIVRTTARDPENIEKVGYLLQLNGAKERLKIMRADLVEEGSFDAAVEGVDGVFHVASPVLVPYDDNVKENLIDPCINGTLNVLRSCKKASSVKRVVLTSSCSSIRYRFDAEEASPLNESHWSDPEYCKRRSLWYGYAKTVAEKEAWNFAHENGLDLVVVNPSFVIGPLLAPQPTSTLLLTLALVKGVRGEFPNTRVGFVHIYDVVNAHILAMEKSEASGRFICSSTVAHWSEIIQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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