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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001728`

染色体: Chr05 坐标: 16678505-16679794 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001728`
名称	SmilChr05G001728
描述	LOB domain-containing protein 40-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16678505 - 16679794 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986362`
GeneID	`130986362`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986362`
原始查询	`LOC130986362`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 40-like
产物	LOB domain-containing protein 40-like
Arabidopsis	`AT3G02550` (LBD41) LOB domain-containing protein 41 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821112] identity=49.1; qcov=0.952; evalue=1.37e-67; confidence=high
Rice	`Os01g0511000` - identity=75.9; qcov=0.435; evalue=6.23e-60; confidence=low
GO	GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986362

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765739.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765739.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765739.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765739.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16679106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C78
`Chr5:16679136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C70
`Chr5:16679143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:16679155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:16679240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C21,D10
`Chr5:16679245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B108,B67,B7,C33
`Chr5:16679245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B67,B7,C33
`Chr5:16679265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B43,C45,C54,C58
`Chr5:16679294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B69,C86
`Chr5:16679299`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,B88,C79
`Chr5:16679299`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B4,B88,C79
`Chr5:16679437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765739.1

248 aa

124

248

LOB

PF03195 LOB 4-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765739.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	4	102	1.4e-21	77.6	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909756.1
GCAGCTTTTATGCAATAATTAAGCAGCTATTTGTGGTTTTGTAGTTTGATTATTAAAATAATTTGAAGTTTGCTACTTTTCGTCCGACTGCCCTAACATGCTTTCTCGACACGACATGACGCATATTATTATTACATCGTATTCGTATCATTAATCCCTGCAAAATAAATAGCCTTCTCTCCCTCTCCTCCGCATCTCTTTAATTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAAATCTTGTCATGAGAATGAGCTGCAATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986362
ATGAGAATGAGCTGCAATGGCTGCAGAGTGCTCCGCAAAGGCTGCATCGAGAACTGCACCCTCAGACCTTGTCTCGAATGGATCGAATCACCTGAATCTCAAGCCAACGCCACTCTCTTTCTCGCCAAATTCTACGGCCGCGCCGGCCTCATCAACCTCATCAAATCCGGCCCCAGCCATCTCCGCCCCGAAATTTTTAGGTCGCTTTTGTACGAAGCCTGCGGCAGGATCATCAGCCCGGTTCACGGCTCGGTCGGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765739.1
MRMSCNGCRVLRKGCIENCTLRPCLEWIESPESQANATLFLAKFYGRAGLINLIKSGPSHLRPEIFRSLLYEACGRIISPVHGSVGLMCSGDWPRCQAAVEAVLRGAPLMNEDDSASGSVMPLQGCDIRHLSKDSAAACHRRGRARNRSKRSAETHANSFAAELMSESEAKFTITGWDDSGEDRKGFSEELKRARSHDSYSVETVEPALVNRSHAIKPELELGEIALELTLGGPNSVFGVIEISDTEN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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