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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001665`

染色体: Chr05 坐标: 15767758-15770830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001665`
名称	SmilChr05G001665
描述	GDT1-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15767758 - 15770830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986365`
GeneID	`130986365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986365`
原始查询	`LOC130986365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDT1-like protein 4
产物	GDT1-like protein 4
Arabidopsis	`AT1G25520` (AT1G25520) Uncharacterized protein family (UPF0016) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839138] identity=73.2; qcov=0.947; evalue=3.91e-103; confidence=high
Rice	`Os08g0433100` - identity=67.9; qcov=0.818; evalue=3.67e-81; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015085 (calcium ion transmembrane transporter activity); GO:0032468 (Golgi calcium ion homeostasis); GO:0032472 (Golgi calcium ion transport); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport); GO:0071421 (manganese ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01169 (GDT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057765745.1`
2	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057765742.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057765745.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765742.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057765745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15768033`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A11,A3,B122,B140,C38
`Chr5:15768033`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A11,A3,B122,B140,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765742.1

232 aa

116

232

GDT1

PF01169 GDT1 9-93 aa PF01169 GDT1 146-228 aa

XP_057765743.1

231 aa

116

231

GDT1

PF01169 GDT1 9-93 aa PF01169 GDT1 146-228 aa

XP_057765745.1

225 aa

112

225

GDT1

PF01169 GDT1 9-93 aa PF01169 GDT1 146-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765742.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	9	93	1.2e-49	167.1	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057765742.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	146	228	1.2e-49	167.1	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057765743.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	9	93	1.1e-49	167.3	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057765743.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	146	228	1.1e-49	167.3	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057765745.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	9	93	8.8e-45	151.6	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057765745.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	146	214	8.8e-45	151.6	Divalent cation/proton antiporter GDT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909762.1
CTCACCCACTATACAATATGCATTCTCTCTCTATGTGTATATCTAATTATATAATGCAGCAACAGAAACAAACATCTCTTAATTTGATCTCTCCAAATCTCAGTTGCCTTTCACCTTCTAAAAGATGGGTCTCTCTGTTGTGCAAGGCTTTACTAAGTCGTTGGCAATGACGGTGCTATCAGAAATTGGAGACAAGACCTTTTTTGCAGCTGCTATATTGGCAATGCGTCATCCGAGAAGGCATGTGCTGTCAGGTTGCC...

XM_057909759.1
CTCACCCACTATACAATATGCATTCTCTCTCTATGTGTATATCTAATTATATAATGCAGCAACAGAAACAAACATCTCTTAATTTGATCTCTCCAAATCTCAGTTGCCTTTCACCTTCTAAAAGATGGGTCTCTCTGTTGTGCAAGGCTTTACTAAGTCGTTGGCAATGACGGTGCTATCAGAAATTGGAGACAAGACCTTTTTTGCAGCTGCTATATTGGCAATGCGTCATCCGAGAAGGCATGTGCTGTCAGGTTGCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986365
ATGGGTCTCTCTGTTGTGCAAGGCTTTACTAAGTCGTTGGCAATGACGGTGCTATCAGAAATTGGAGACAAGACCTTTTTTGCAGCTGCTATATTGGCAATGCGTCATCCGAGAAGGCATGTGCTGTCAGGTTGCCTTGGAGCTTTAATAGTAATGACCATACTGTCAGCTGTTGTGGGCTGGGCTGCTCCCAATCTGCTTTCGCGCAAGTGGACTCATCACATCACAACAATGCTGTTTCTTGGTTTTGGCCTGCGGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765742.1
MGLSVVQGFTKSLAMTVLSEIGDKTFFAAAILAMRHPRRHVLSGCLGALIVMTILSAVVGWAAPNLLSRKWTHHITTMLFLGFGLRSLWDAFNDVEAEDLAVVEKELNADFRCNSTEAKESYKDDDDDLKKKGRPFLTQFFSPISLKAFTITFFGEWGDKSQLATIGLAAEENPLGVVLGGILGQALCTAAAVLGGKSLATQISEKIVALSGGILFIIFGIQSLLSTVESFY

XP_057765743.1
MGLSVVQGFTKSLAMTVLSEIGDKTFFAAAILAMRHPRRHVLSGCLGALIVMTILSAVVGWAAPNLLSRKWTHHITTMLFLGFGLRSLWDAFNDVEAEDLAVVEKELNADFRCNSTEAKESYKDDDDDLKKKGRPFLTQFFSPISLKAFTITFFGEWGDKSQLATIGLAAEENPLGVVLGGILGQALCTAAAVLGGKSLATQISEKIVALSGGILFIIFGIQSLLSTVESL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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