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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001675`

染色体: Chr05 坐标: 15880945-15881939 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001675`
名称	SmilChr05G001675
描述	30S ribosomal protein 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	15880945 - 15881939 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986378`
GeneID	`130986378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986378`
原始查询	`LOC130986378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein 3, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G68590` (PSRP3/1) Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843189] identity=58.5; qcov=0.921; evalue=1.5e-54; confidence=high
Rice	`Os04g0461100` - identity=52.7; qcov=1.13; evalue=4.64e-48; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04839 (PSRP-3_Ycf65)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765768.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057765768.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057765768.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765768.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:15881264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10
`Chr5:15881265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10
`Chr5:15881384`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	50	A1,A19,A2,A4,B100,B106,B123,B125,B136,B17,B19,B29,B33,B41,B50,B51,B53,B55,B67,B68,B69,B7,B75,B78,B79,B83,B85,B87,B88,B91,B95,C11,C13,C19,C2,C22,C23,C25,C35,C37,C46,C59,C69,C7,C71,C72,C77,C78,C85,D9
`Chr5:15881407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:15881615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B41,C42
`Chr5:15881657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765768.1

165 aa

165

PSRP-3_Ycf65

PF04839 PSRP-3_Ycf65 113-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765768.1`	Pfam	`PF04839`	PSRP-3_Ycf65	Family	113	159	1.9e-26	92.7	Plastid and cyanobacterial ribosomal protein (PSRP-3 / Ycf65)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909785.1
ATTAACAATGGTGTCATTTTCTATGAACAAAGAAACAAAGTCCAGTTTTTTAAGTACTATGGGCTTATATTATCAAACCAAAAAAAAAAAGTATTATGGGCTTATATCGATGCCAAATCTAATTTGAAGCCCAATAGAAATAAACAATGGATATCTCATTTTGTAGAGGCCCATGGCCCTCCCTTCTCTTCTAGATTTGTTACCTTATCCCATCAAGACTCAGGTATTCGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986378
ATGTTATCCATGTCAGTTCAACCAAGCATAACAAGCAGGCCTTCCTCTGTTTTCAAGAACATCTCCTCCGCACCCTCAAAAACCTCATTTTCTGTGAACCCAAGAGCTTCCCACTTGCGCTCTTCTTACCTGAAATCCAAGTCCACTAGTTTTGTCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCACAGAAGTAGCTCCGGCAGAAACACCCGCCGACGCCGAACTCGTTCCACAACCGCAGACAGGTGCAGTGGGTGCGCGTCTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765768.1
MLSMSVQPSITSRPSSVFKNISSAPSKTSFSVNPRASHLRSSYLKSKSTSFVAAAAAAATEVAPAETPADAELVPQPQTGAVGARLVLKFIWMEKNIGLGLDQSIPGHGTVPLSPYFFWPRKDAWEELKATLENKPWISQKKMIILLNQATDIINLWQQSGGNLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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