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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001737`

染色体: Chr05 坐标: 16774704-16778739 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001737`
名称	SmilChr05G001737
描述	cysteine--tRNA ligase 2, cytoplasmic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16774704 - 16778739 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986405`
GeneID	`130986405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986405`
原始查询	`LOC130986405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine--tRNA ligase 2, cytoplasmic-like
产物	cysteine--tRNA ligase 2%2C cytoplasmic-like
Arabidopsis	`AT5G38830` (AT5G38830) Cysteinyl-tRNA synthetase, class Ia family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833874] identity=62; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0556500` - identity=63.5; qcov=0.947; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004817 (cysteine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006423 (cysteinyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01406 (tRNA-synt_1e); PF09334 (tRNA-synt_1g)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765784.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765784.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057765784.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765784.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16778094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765784.1

532 aa

266

532

tRNA-synt_1e

tRNA-synt_1g

PF01406 tRNA-synt_1e 21-317 aa PF09334 tRNA-synt_1g 42-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765784.1`	Pfam	`PF01406`	tRNA-synt_1e	Domain	21	317	2.5e-128	428.4	tRNA synthetases class I (C) catalytic domain
`XP_057765784.1`	Pfam	`PF09334`	tRNA-synt_1g	Family	42	150	3.1e-12	46.7	tRNA synthetases class I (M)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909801.1
CTCATAAAGAAAAAGGTTACAGTCAAATAGTACTAAATATATACGAAATACTGTAAACAGAAATTCCATAAACCGCAGTAAGGTTTTGTTTTCTGAGCACTCCGATTTGCACCAGAGCAAAAGCAAAGCCCTCAGATTCAACAGCTGCGGTCTATCAGCAATTGGCATTTTCTGTCAATTACTAAGAAAATGGAGGGGAAGAAGCCGGAGCTTCAATTGTATAACAGTATGACGAAGGAGAAGGAGGTATTTAAGCCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986405
ATGGAGGGGAAGAAGCCGGAGCTTCAATTGTATAACAGTATGACGAAGGAGAAGGAGGTATTTAAGCCCATTGTTGAGGGCAAAGTGGGGATGTATATTTGCGGCGTCACCTCTTACGATCTCAGCCACATCGGCCACGCGCGCGCCTACGTTGCGTTCGATGTTCTCTACAGATATCTCAAATATTTGGGCTATGATGTTGCTTATGTGCGGAATTTCACTGATGTTGATGACAAGATTATTCGCCGAGCAAATGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765784.1
MEGKKPELQLYNSMTKEKEVFKPIVEGKVGMYICGVTSYDLSHIGHARAYVAFDVLYRYLKYLGYDVAYVRNFTDVDDKIIRRANEVGEDPIALSGRFCQEFLNDMADLQCLLPTNQPRVTDHMEQIKDMISKIISNGCAYAVDGDVYFSVDNFPNYGRLSGRKLEDNRAGERVAVDTRKKNPADFALWKAAKPGEPQWDSPWGPGRPGWHIECSAMSAHYLTHTFDIHGGGMDLIFPHHENEIAQSCAACSESKVNYWI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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