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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002747`

染色体: Chr01 坐标: 45796170-45797467 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002747`
名称	SmilChr01G002747
描述	cytidine deaminase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45796170 - 45797467 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986407`
GeneID	`130986407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986407`
原始查询	`LOC130986407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytidine deaminase 1-like
产物	cytidine deaminase 1-like
Arabidopsis	`AT2G19570` (CDA1) cytidine deaminase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816476] identity=53.5; qcov=0.942; evalue=3.89e-107; confidence=high
Rice	`Os01g0712700` - identity=48.5; qcov=0.933; evalue=1.11e-66; confidence=high
GO	GO:0004126 (cytidine deaminase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009972 (GO:0009972)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00383 (dCMP_cyt_deam_1); PF08211 (dCMP_cyt_deam_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765789.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765789.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765789.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765789.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45797292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,B99,C68,C71,C9
`Chr1:45797334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765789.1

345 aa

172

345

dCMP_cyt_deam_1

dCMP_cyt_deam_2

PF00383 dCMP_cyt_deam_1 36-121 aa PF08211 dCMP_cyt_deam_2 157-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765789.1`	Pfam	`PF00383`	dCMP_cyt_deam_1	Domain	36	121	1e-15	58.1	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
`XP_057765789.1`	Pfam	`PF08211`	dCMP_cyt_deam_2	Family	157	314	1.3e-45	155.5	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909806.1
AGAAAGTGAGTTGACGAGCTATTTGAAACACAAGCACCACATCCCCCTTATAAATACACCACCACCACCACCACCTCCTCCTCCGCAACCATCATCACCACCACCACCTCCTCTCCAATTTCTCACTCTTCCTCTGTATATCACACACAGACGCACGCGCACAATGAATCAGCATGGCACGACTGTGACGCAATTCGTGATGGAAGCCTCAGTGGCGGAATCCATCGCCCAATCTCTGAACCTCCCCTCCGTCCTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986407
ATGAATCAGCATGGCACGACTGTGACGCAATTCGTGATGGAAGCCTCAGTGGCGGAATCCATCGCCCAATCTCTGAACCTCCCCTCCGTCCTCCACCTCCTCCCGCATCTCGTCCACTCCGCCCAGTCCCTCGCCCGCCCCCCTATCTCCAACTTCCACGTCGGCGCCGTCGGCCTCGGCTCCGACGGCCGCGTCTTCGTCGGCGTCAATCTCGAATTCCCCGGCGTCCCCCTCCACCAATCCGTCCACGCCGAGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765789.1
MNQHGTTVTQFVMEASVAESIAQSLNLPSVLHLLPHLVHSAQSLARPPISNFHVGAVGLGSDGRVFVGVNLEFPGVPLHQSVHAEQFLLTNLQLHRCPTLLAVAVSAAPCGHCRQFYQELRHSASLQILVTDEDNCVQNHDRIRMLENKAPDFMPLLKFLPNPFGPRDLLDDEAPLLLEQHHNHLDLLDQDDSHTDDYSVNPCNGNDISGKLSNGNCRNHEINESLLREAALEAANNAHAPYSGCPSGVALMDCEGKVYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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