当前解析结果
SmilChr05G001738| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001738 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001738 |
| 描述 | zinc finger protein GIS3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 16784693 - 16785869 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986408 |
|---|---|
| GeneID | 130986408 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986408 |
| 原始查询 | LOC130986408 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger protein GIS3-like |
| 产物 | zinc finger protein GIS3-like |
| Arabidopsis | AT1G68360 (AT1G68360)C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843165] identity=45.5; qcov=1.22; evalue=3.99e-54; confidence=high |
| Rice | Os01g0132766- identity=43.5; qcov=0.99; evalue=3.21e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0010026 (trichome differentiation); GO:0010090 (trichome morphogenesis) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986408 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057765785.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765785.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765785.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765785.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057765785.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:16785169 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,A5,B101,B70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。