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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001744`

染色体: Chr05 坐标: 16936938-16942558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001744`
名称	SmilChr05G001744
描述	uncharacterized SmilChr05G001744
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	16936938 - 16942558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986414`
GeneID	`130986414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986414`
原始查询	`LOC130986414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0041P03.3; symbol=OSJNBa0041P03.3; hit=Os10g0495000; species=rice; confidence=low
产物	OSJNBa0041P03.3; symbol=OSJNBa0041P03.3; hit=Os10g0495000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15270` (AT5G15270) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831379] identity=29.8; qcov=0.663; evalue=1.58e-27; confidence=low
Rice	`Os10g0495000` (OSJNBa0041P03.3) - identity=30.4; qcov=0.678; evalue=1.44e-29; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765800.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057765800.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765800.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765800.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:16937777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B27,B48,C2,C34
`Chr5:16937837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C21,C31
`Chr5:16937912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:16937913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:16938075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B140,C15,C16
`Chr5:16938128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:16940021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B140,C15,C16
`Chr5:16940208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:16940770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:16941366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:16941395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B52,C29,C7,C86
`Chr5:16942338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765800.1

451 aa

226

451

KH_1

PF00013 KH_1 98-153 aa PF00013 KH_1 191-259 aa PF00013 KH_1 299-362 aa

XP_057765801.1

451 aa

226

451

KH_1

PF00013 KH_1 98-153 aa PF00013 KH_1 191-259 aa PF00013 KH_1 299-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765800.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	98	153	5.7e-38	129.2	KH domain
`XP_057765800.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	191	259	5.7e-38	129.2	KH domain
`XP_057765800.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	299	362	5.7e-38	129.2	KH domain
`XP_057765801.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	98	153	5.7e-38	129.2	KH domain
`XP_057765801.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	191	259	5.7e-38	129.2	KH domain
`XP_057765801.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	299	362	5.7e-38	129.2	KH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909817.1
AAAAAGTCATAGATATAAGAAATTACTGTACTAGTTTATAGCGACATCGAGAAAAGATACGAGCAAGCCAATTCCCAATAGATCAGGCCCTTTCCTCCGCTGCCGTCTCTTTTCTTAGCTCCCCTTCCATAACCCCAGCTCCCACCGCGCTCCTCGTTAATCCGCCGCCACCCCCTTTCACCTACTCCCCCTCCACAACCCTGATTCGCGATCCCTGCGCGCCAAAATCTTGAATAAGTAATGAATTTGGATTAAATGGA...

XM_057909818.1
GTACTAGTTTATAGCGACATCGAGAAAAGATACGAGCAAGCCAATTCCCAATAGATCAGGCCCTTTCCTCCGCTGCCGTCTCTTTTCTTAGCTCCCCTTCCATAACCCCAGCTCCCACCGCGCTCCTCGTTAATCCGCCGCCACCCCCTTTCACCTACTCCCCCTCCACAACCCTGATTCGCGATCCCTGCGCGCCAAAATCTTGAATAAGTAATGAATTTGGATTAAATGGAAGGAAAGGAGGGATCGTGCCGCTGCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986414
ATGTCGCAAGCGGAAACACCTGTGAACCCAAGAAGAAACCAGGCTCCATCTTCAACCACAAATATTCCTCTGGAATCAGATCCTCATCTTAACCCTGGTACGGCGCCAGTGCCAGCCAAGCCTACTGTTGTGTCCGATATCTCAGATCTTGCCAATACTTCTCTTGCATTGACCACAGCGTCTATGGCCGGAACTCTCAAGAGGCCCCGCGAAGAGGATTCTGTGGAGGCTGGGACCTCAGTTGATTTGCCAGAAGCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765800.1
MSQAETPVNPRRNQAPSSTTNIPLESDPHLNPGTAPVPAKPTVVSDISDLANTSLALTTASMAGTLKRPREEDSVEAGTSVDLPEAKRRIKATHDVIYRIVVPSRQIGKVIGRAGHRIQKIREDTQATIKIADAISKHEERVIIISSKDSDNVFSDAENAVHQIVTLILKDDDGNAEAVKIGPGHVPANAVRLLIAGSQAGGLIGVSGQNIVNLRNTSGASIAVLSPNQLPPCASAHESDRVVQISGEIPAVLRAVVEIG...

XP_057765801.1
MSQAETPVNPRRNQAPSSTTNIPLESDPHLNPGTAPVPAKPTVVSDISDLANTSLALTTASMAGTLKRPREEDSVEAGTSVDLPEAKRRIKATHDVIYRIVVPSRQIGKVIGRAGHRIQKIREDTQATIKIADAISKHEERVIIISSKDSDNVFSDAENAVHQIVTLILKDDDGNAEAVKIGPGHVPANAVRLLIAGSQAGGLIGVSGQNIVNLRNTSGASIAVLSPNQLPPCASAHESDRVVQISGEIPAVLRAVVEIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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