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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001799`

染色体: Chr05 坐标: 17739206-17744259 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001799`
名称	SmilChr05G001799
描述	sulfhydryl oxidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17739206 - 17744259 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986462`
GeneID	`130986462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986462`
原始查询	`LOC130986462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfhydryl oxidase 2-like
产物	sulfhydryl oxidase 2-like
Arabidopsis	`AT1G15020` (QSOX1) quiescin-sulfhydryl oxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838067] identity=63.6; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0552500` (OsQSOXL1) - identity=59.7; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0003756 (protein disulfide isomerase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0006457 (protein folding); GO:0016971 (flavin-dependent sulfhydryl oxidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF04756 (OST3_OST6); PF04777 (Evr1_Alr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765860.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057765860.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765860.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765860.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17739897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:17741384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:17741504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765860.1

522 aa

261

522

OST3_OST6

Thioredoxin

Evr1_Alr

PF04756 OST3_OST6 53-186 aa PF00085 Thioredoxin 56-146 aa PF04777 Evr1_Alr 315-397 aa

XP_057765861.1

518 aa

259

518

OST3_OST6

Thioredoxin

Evr1_Alr

PF04756 OST3_OST6 53-186 aa PF00085 Thioredoxin 56-146 aa PF04777 Evr1_Alr 315-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765860.1`	Pfam	`PF04756`	OST3_OST6	Family	53	186	8.5e-08	32.7	OST3 / OST6 family, transporter family
`XP_057765860.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	56	146	2e-13	51.0	Thioredoxin
`XP_057765860.1`	Pfam	`PF04777`	Evr1_Alr	Family	315	397	3.3e-20	73.0	Erv1 / Alr family
`XP_057765861.1`	Pfam	`PF04756`	OST3_OST6	Family	53	186	8.5e-08	32.7	OST3 / OST6 family, transporter family
`XP_057765861.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	56	146	1.9e-13	51.0	Thioredoxin
`XP_057765861.1`	Pfam	`PF04777`	Evr1_Alr	Family	315	397	3.3e-20	73.0	Erv1 / Alr family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909878.1
AGTATTGTTTTTAAAGCCATAATTAATTGTGTGAAATAACTAATACTAGCATTAATTGTCATATATCTAATTAAACGTACAACCATTAAAGCCCAGGGCACCACGAGAAACATCATAAAGCAGAAAGCTGGTGTACCAATGGAGTCAGTGACGTTCCTCTTTGAAGTCCCAAAATTTTCAACTCGGTAGGTGCAGTGCGCACCCTTCCCTTCGCCTTCGCCATCGCCAAAGCGGCGATCGCCGGCTATCCAAACGGCACC...

XM_057909877.1
TTAATTGTCATATATCTAATTAAACGTACAACCATTAAAGCCCAGGGCACCACGAGAAACATCATAAAGCAGAAAGCTGGTGTACCAATGGAGTCAGTGACGTTCCTCTTTGAAGTCCCAAAATTTTCAACTCGGTAGGTGCAGTGCGCACCCTTCCCTTCGCCTTCGCCATCGCCAAAGCGGCGATCGCCGGCTATCCAAACGGCACCGTAACGCCCCCAATCTCGTGAACCTCTGCGAAATATATACATACACATTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986462
ATGTCTTCTGTAGCCACTATCACTCTGTTAATCCAAACGCTGTTTTTATATACCAACGTAGCGTCTCTGCCGCCGGCGATTTCGGTTCCAGCGCCGTTTGCAGCTGGATCTCGTTCGCTGCTGCGATCTATCGACGGCGATAAATCTGAAAAACCTGATTACGCGGTGGAATTGAACGCCACGAACTTCGATTCCGTGCTCAGCGAAACCCCCGCTACTTATGCTATTGTAGAATTTTTCGCTCACTGGTGCCCAGCTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765860.1
MSSVATITLLIQTLFLYTNVASLPPAISVPAPFAAGSRSLLRSIDGDKSEKPDYAVELNATNFDSVLSETPATYAIVEFFAHWCPACRNYKPQYEKVAKIFNGADAAHPGIILLTRVDCAQKINTNLCDKFSVAHYPTLLWGPPSKFVHGSFDPNQGKGEILSILDGRTAERLLSWINKQLSSLYQLDDQKYENDQLQKNSSDTGQIARAIYDIEEATSTAFNIILDHKMIKSENRVSLVMFFQLLVVHHPSRRCRKGTA...

XP_057765861.1
MSSVATITLLIQTLFLYTNVASLPPAISVPAPFAAGSRSLLRSIDGDKSEKPDYAVELNATNFDSVLSETPATYAIVEFFAHWCPACRNYKPQYEKVAKIFNGADAAHPGIILLTRVDCAQKINTNLCDKFSVAHYPTLLWGPPSKFVHGSFDPNQGKGEILSILDGRTAERLLSWINKQLSSLYQLDDQKYENDQLQKNSSDTGQIARAIYDIEEATSTAFNIILDHKMIKSENRVSLVMFFQLLVVHHPSRRCRKGTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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