当前解析结果
SmilChr05G001802| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001802 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001802 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001802 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 17798471 - 17799306 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986475 |
|---|---|
| GeneID | 130986475 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986475 |
| 原始查询 | LOC130986475 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814658]; symbol=AT2G01300; hit=AT2G01300; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814658]; symbol=AT2G01300; hit=AT2G01300; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G01300 (AT2G01300)mediator of RNA polymerase II transcription subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814658] identity=51.4; qcov=0.682; evalue=3.28e-34; confidence=medium |
| Rice | Os01g0121500- identity=41.4; qcov=0.643; evalue=2.14e-25; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986475 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057765886.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057765886.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.20000 | XP_057765886.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765886.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765886.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:17798714 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,B9 |
Chr5:17798719 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,C33 |
Chr5:17798943 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。