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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001817`

染色体: Chr05 坐标: 18181029-18184556 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001817`
名称	SmilChr05G001817
描述	protein WVD2-like 7
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18181029 - 18184556 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986489`
GeneID	`130986489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986489`
原始查询	`LOC130986489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WVD2-like 7
产物	protein WVD2-like 7
Arabidopsis	`AT1G70950` (AT1G70950) TPX2 (targeting protein for Xklp2) protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843433] identity=56.9; qcov=0.229; evalue=5.68e-30; confidence=weak
Rice	`Os02g0200800` (BIP118) - identity=55.9; qcov=0.174; evalue=4.6e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06886 (TPX2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057765898.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057765898.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765898.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057765898.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765899.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18181283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D10
`Chr5:18181334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,D7
`Chr5:18181421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:18182246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr5:18182390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182908`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182908`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B91,B97
`Chr5:18182984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765898.1

540 aa

270

540

TPX2

PF06886 TPX2 367-434 aa

XP_057765899.1

537 aa

268

537

TPX2

PF06886 TPX2 367-432 aa

XP_057765900.1

536 aa

268

536

TPX2

PF06886 TPX2 367-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765898.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	367	434	2.3e-23	82.6	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain
`XP_057765899.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	367	432	2.7e-23	82.4	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain
`XP_057765900.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	367	432	1.1e-23	83.7	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909917.1
ATGATCATGTATTACTACACACTACGAAGAAGCTCACTTCTGCATCCATCACATTTCTCTCTCAACTCCCCATCTTTCTTTTAAATCTCAATCATTTCTTATGATTTAAAGCCCAAAAATTGCTTCTTTTCACATCATAATCACTCTCGCTATCAACTTCGATCCCAAGAAAATACAGAAAAGGGATCACATCCATATTCTTCCGCCTATTGGTCTTGAATTCTTTTTATGCTTGGAAACGTTATGGTTTTGAGCAGTTA...

XM_057909916.1
ATGATCATGTATTACTACACACTACGAAGAAGCTCACTTCTGCATCCATCACATTTCTCTCTCAACTCCCCATCTTTCTTTTAAATCTCAATCATTTCTTATGATTTAAAGCCCAAAAATTGCTTCTTTTCACATCATAATCACTCTCGCTATCAACTTCGATCCCAAGAAAATACAGAAAAGGGATCACATCCATATTCTTCCGCCTATTGGTCTTGAATTCTTTTTATGCTTGGAAACGTTATGGTTTTGAGCAGTTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986489
ATGGCTGGTGAGATTGGAGAACCAGTCAGACTTCAATTTAAGGCTGAATCTTTTCTTTCGGGATCTATATCATTTGGAAGGTTTGAAAGTGAAGATCTATGTTGGGAGAGGAGGTCATCTTTCTCTCATAATAGGTATCTTGAAGAGGTTGAAAAATGCTCAAAGCCCGGTTCAGTTACTGAGAAGAAAGCTATTCTTGAGGCTCATTTTAGAAAGAAGGGGCTTTTTGGTCTTTGTTCCCCTGGAAGTCGGAGTGAGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765898.1
MAGEIGEPVRLQFKAESFLSGSISFGRFESEDLCWERRSSFSHNRYLEEVEKCSKPGSVTEKKAILEAHFRKKGLFGLCSPGSRSETDCQTSDNEASEKRCYDDDFMHTHSPKLDERLDDSASGSEHELREQEAEVSGSSSLDAQIEYSCDNARDVDYFSERGMVEEEHHSKPRMDSRLETEVKEALDLDAANSDTADVSNPVIGLLSDNQAAEENRDASPKEQVSSSEENVPSQAEHVKPRLVRRVSVTQTRRYTSSKE...

XP_057765899.1
MAGEIGEPVRLQFKAESFLSGSISFGRFESEDLCWERRSSFSHNRYLEEVEKCSKPGSVTEKKAILEAHFRKKGLFGLCSPGSRSETDCQTSDNEASEKRCYDDDFMHTHSPKLDERLDDSASGSEHELREQEAEVSGSSSLDAQIEYSCDNARDVDYFSERGMVEEEHHSKPRMDSRLETEVKEALDLDAANSDTADVSNPVIGLLSDNQAAEENRDASPKEQVSSSEENVPSQAEHVKPRLVRRVSVTQTRRYTSSKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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