当前解析结果
SmilChr05G001827| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001827 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001827 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001827 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 18285798 - 18287862 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986499 |
|---|---|
| GeneID | 130986499 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986499 |
| 原始查询 | LOC130986499 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986499 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057765912.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057765912.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057765912.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765912.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765912.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:18286177 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B5,C6,D3 |
Chr5:18286179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B36,C37,C77 |
Chr5:18286190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr5:18286200 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,C39 |
Chr5:18286204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr5:18286216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C56,C65,D1 |
Chr5:18286218 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,B42,B72,C36 |
Chr5:18286224 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr5:18286225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr5:18286233 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B5,C6,D3 |
Chr5:18286270 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B113,B125 |
Chr5:18286311 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B1,B35,B36,B42 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。