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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001834`

染色体: Chr05 坐标: 18372132-18376940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001834`
名称	SmilChr05G001834
描述	protein ESMERALDA 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18372132 - 18376940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986505`
GeneID	`130986505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986505`
原始查询	`LOC130986505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ESMERALDA 1-like
产物	protein ESMERALDA 1-like
Arabidopsis	`AT2G01480` (AT2G01480) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814676] identity=71.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0841200` - identity=72.5; qcov=0.599; evalue=3.21e-151; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057765917.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057765917.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765919.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765919.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18372507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:18372642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:18372673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:18373695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B4,B60,C27,C9
`Chr5:18374156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:18376142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:18376144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:18376150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765917.1

561 aa

280

561

O-FucT

PF10250 O-FucT 153-483 aa

XP_057765919.1

495 aa

248

495

O-FucT

PF10250 O-FucT 153-198 aa PF10250 O-FucT 198-417 aa

XP_057765920.1

456 aa

228

456

O-FucT

PF10250 O-FucT 153-446 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765917.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	153	483	1.4e-96	324.8	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057765919.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	153	198	1.4e-75	255.9	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057765919.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	198	417	1.4e-75	255.9	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057765920.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	153	446	7.1e-82	276.5	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909934.1
TAAATGAATAAATAAGGAATCGTGACTTCCCTTGCTTGGGATGGTTGCGTCGACATCAACGCCGTTACCCAAACAGGGTCTAACAATTTCTGCATCATCGTTCCTCTCTCTCACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCATCTGCACGATTACCCTAGTTTCTTTCACGATTTTGAATCCTTTCGGATAAATTCACTATCACCGCGAATTGTTTACAATAATGCCAATAAAACAGCGATGAAACCGTACAAATTCCCCAGCAGC...

XM_057909936.1
AATGAATAAATAAGGAATCGTGACTTCCCTTGCTTGGGATGGTTGCGTCGACATCAACGCCGTTACCCAAACAGGGTCTAACAATTTCTGCATCATCGTTCCTCTCTCTCACTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCATCTGCACGATTACCCTAGTTTCTTTCACGATTTTGAATCCTTTCGGATAAATTCACTATCACCGCGAATTGTTTACAATAATGCCAATAAAACAGCGATGAAACCGTACAAATTCCCCAGCAGCGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986505
ATGAAACCGTACAAATTCCCCAGCAGCGGAAATTGCAGCCCGAGATCGCCGCCGGCGTCTCCCCGGCCGCGCAGCCGCTCTCCGCGCTACCGCCACCGTTCCGGAAAGCCAGTCCGGCCAGCTTCTAAATCACTCGCTCAGCGGCTCGGGTGGCTCCTGCTCTCCCTACTGCTCAAGCGCCAGGGCCTCTTTCTCTTTGCTCCCCTGCTTTACCTTTCGGTCATGTTGTTCTACATGGGAACGGTGCCGTATGATATTGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765917.1
MKPYKFPSSGNCSPRSPPASPRPRSRSPRYRHRSGKPVRPASKSLAQRLGWLLLSLLLKRQGLFLFAPLLYLSVMLFYMGTVPYDIVPVSKLRHPPGSLYRSPQLYAKLRSEMDSDNSSVDAISTIWKNSYKGGEWRPCIKKSSGGLPESNGYIYVEANGGLNQQRTSICNAVAVAAYLNATLIIPYFHFHSIWRDSSKFNDIYDEELFIKTLERDVQIVKTIPGYIMERFDHNLSNVYNFRIQAWSSINYYRDIVLPKL...

XP_057765919.1
MKPYKFPSSGNCSPRSPPASPRPRSRSPRYRHRSGKPVRPASKSLAQRLGWLLLSLLLKRQGLFLFAPLLYLSVMLFYMGTVPYDIVPVSKLRHPPGSLYRSPQLYAKLRSEMDSDNSSVDAISTIWKNSYKGGEWRPCIKKSSGGLPESNGYIYVEANGGLNQQRTSICNAVAVAAYLNATLIIPYFHFHSIWRDSRIIRLSPFANRLSTDAPPAVQRLRCLTNYQALNFSDPISTLGKILVERMKKHSAKNGGKYVSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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