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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001852`

染色体: Chr05 坐标: 18544751-18545591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001852`
名称	SmilChr05G001852
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18544751 - 18545591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986523`
GeneID	`130986523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986523`
原始查询	`LOC130986523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3, chloroplastic
产物	probable NAD(P)H dehydrogenase subunit CRR3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G01590` (CRR3) chlororespiratory reduction 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814688] identity=41; qcov=0.718; evalue=2.23e-29; confidence=medium
Rice	`Os09g0306650` - identity=37.8; qcov=0.653; evalue=1.3e-14; confidence=low
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0010598 (NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone))
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765936.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057765936.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057765936.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057765936.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057765936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18544820`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,B110,B13,B83,C10,C13,C48,C52,C77
`Chr5:18544824`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A18,B117,B46,D11
`Chr5:18544824`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A18,B117,B46,D11
`Chr5:18544826`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,B117,B46,B66,D11
`Chr5:18544826`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A18,B117,B46,B66,D11
`Chr5:18544868`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B140,C85
`Chr5:18544868`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B140,C85
`Chr5:18544870`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,C85
`Chr5:18544870`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B140,C85
`Chr5:18545363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:18545389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909953.1
CGCTCTATGGCTATCCTCCTCAGCTCTGGTTCCATCACCAAGCTTGAGGTTGTGGCTTCTTCCTCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTCAATCACAGCAGCAACAGCAACAGCCATCGCGCATTATTAAGATGAGGCCTAATAAACTCGCAAACAAAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCCGTCTATTTTGGAAATTGAACGGGCCATTGGTGCCGGCATTTTTCGGGAGAGAGACGTGAACAGTGGAGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986523
ATGGCTATCCTCCTCAGCTCTGGTTCCATCACCAAGCTTGAGGTTGTGGCTTCTTCCTCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTCAATCACAGCAGCAACAGCAACAGCCATCGCGCATTATTAAGATGAGGCCTAATAAACTCGCAAACAAAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCCGTCTATTTTGGAAATTGAACGGGCCATTGGTGCCGGCATTTTTCGGGAGAGAGACGTGAACAGTGGAGCAGATGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765936.1
MAILLSSGSITKLEVVASSSSSSSSSSSSQSQQQQQQPSRIIKMRPNKLANKKQQQQQQQPSILEIERAIGAGIFRERDVNSGADGEKTSLFDNILRNSVGKNEGSVEKRLRETGEWLLHQTETTSRSAGKQILTTIFVWMIPLWISAFLVATGLLSLPFDAPFLDDLIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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