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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001856`

染色体: Chr05 坐标: 18582849-18584213 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001856`
名称	SmilChr05G001856
描述	probable carboxylesterase 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18582849 - 18584213 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986524`
GeneID	`130986524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986524`
原始查询	`LOC130986524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 2
产物	probable carboxylesterase 2
Arabidopsis	`AT1G47480` (AT1G47480) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841155] identity=54.3; qcov=0.987; evalue=3.18e-121; confidence=high
Rice	`Os09g0462200` - identity=46.1; qcov=0.994; evalue=1.6e-97; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00135 (COesterase); PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765937.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765937.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057765937.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765937.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18583229`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr5:18583229`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr5:18583262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B52,C29,C43,C7
`Chr5:18583483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:18583487`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583487`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583490`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583490`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583496`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583496`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B70,C48
`Chr5:18583517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765937.1

319 aa

160

319

COesterase

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF00135 COesterase 59-175 aa PF20434 BD-FAE 64-169 aa PF07859 Abhydrolase_3 74-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765937.1`	Pfam	`PF00135`	COesterase	Domain	59	175	4.9e-09	36.4	Carboxylesterase family
`XP_057765937.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	64	169	1.3e-12	48.4	BD-FAE
`XP_057765937.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	74	296	7.4e-52	176.9	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909954.1
TTAGATCACATCTATATCGTAATTTGTAATTTTGATAGGATTTTTAAAAGTTGATAGTCAATTACTTGATTTATAGTATTTTTTTTGCAAGTTGAAATCAGATCCTATTTTGGACCACCACAAAAATTAAGCATTGTCCGTAATCAGCTCGGAACACTGATATTGTCAGGAAAATCATTTAGCCAAGCCAACTCTCAAGACAACGGGCTGAAAATGTTTTAAGTCCCAATATAAAGGGTGCATTCTTATGCAGTTCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986524
ATGAATCCGAAGACTGTAGTCGATGAGGTTCCACCATACCTACGCGTATACCAAGATGGAACCATAGAGAGACTCGTAGGCACAGATTTCGCCCCACCAACTCTCGACCCCGAAACCGGCGTTTCCTCAAAAGACGTCCTCTTCCACCCGGAAACCGGCGTCTCCGCCCGTCTCTACCGCCCCAACCTCGCCGCCCACCACCAAACCAAACTCCCCCTCGTGATCTACTTCCACGGCGGCGCATTCTGCATCTCCTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765937.1
MNPKTVVDEVPPYLRVYQDGTIERLVGTDFAPPTLDPETGVSSKDVLFHPETGVSARLYRPNLAAHHQTKLPLVIYFHGGAFCISSTADPKYHAMLNILVNHAQIILVSVDYRLAPEHPLPAAYHDSWAALQWVAAHLSGAASENWITEHVDFDRVFLAGDSAGANISHHLSIRAGSPGRALGELKIRGVLMIQPYFWGEEAIGAEAENPVFKAVVDKWWRFVCPSDLGCDDPLINPFVSGAPSLDGLGCGRVLVCVAGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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