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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001867`

染色体: Chr05 坐标: 18807865-18810753 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001867`
名称	SmilChr05G001867
描述	uncharacterized SmilChr05G001867
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18807865 - 18810753 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986534`
GeneID	`130986534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986534`
原始查询	`LOC130986534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831969]; symbol=AT5G18510; hit=AT5G18510; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831969]; symbol=AT5G18510; hit=AT5G18510; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G18510` (AT5G18510) Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831969] identity=20.2; qcov=0.497; evalue=1.53e-09; confidence=weak
Rice	`Os03g0565300` - identity=24; qcov=0.294; evalue=2.18e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765949.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765949.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765949.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765949.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057765949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18807901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A21,C2
`Chr5:18807920`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr5:18807920`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr5:18807929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:18807936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A4,B112,B126,B14
`Chr5:18807943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C38,C78
`Chr5:18808002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B126,B14
`Chr5:18808039`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B123,B14,B20,B58,B66,C12,C26,C60
`Chr5:18808044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B80,C53
`Chr5:18808051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B1,B51,C76
`Chr5:18808061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:18808073`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B108,B122,B125,B140,B33,B7,B8,C23,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765949.1

877 aa

438

877

PMD

PF10536 PMD 307-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765949.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	307	552	8.8e-26	91.6	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909966.1
AGTCTGGATGTGTTGCTTCCTTGCAGTGTCACGATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAATGGTCAAGACTATTTGCTGATCTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCACGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAGTGGACTAGCGAGATTAGTTTGAACAAAGTGTTGAGGGCTCACACATTGCATCCGGCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986534
ATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAATGGTCAAGACTATTTGCTGATCTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCACGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAGTGGACTAGCGAGATTAGTTTGAACAAAGTGTTGAGGGCTCACACATTGCATCCGGCTCGTCCTTGGCGAAGCAAAGAGTCCAATTTTCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765949.1
MVVFKDIVVNGQDYLLILSDDEQETEMGTHLRVFPALIGHYVKPWPKLLNSLYQSEWTSEISLNKVLRAHTLHPARPWRSKESNFLLTLRRRIIDKDAKWGRVTSFRGEFHFFEGYWEWTEDILSRCGNELRVVGIYDAVYASLFTYDCQPEMVKAFCEAWCPATNTILTSSGEMSISLWDLQYLSGLPCTGTLYDEVVPCAKEILGKDQFGNPFIPLSCGYLLSAYYSLKHRDGKDPKSSVSIDEWIKFWSKKASKYSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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