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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002765`

染色体: Chr01 坐标: 46045836-46050611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002765`
名称	SmilChr01G002765
描述	uncharacterized SmilChr01G002765
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46045836 - 46050611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986538`
GeneID	`130986538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986538`
原始查询	`LOC130986538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823913]; symbol=AT3G47590; hit=AT3G47590; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823913]; symbol=AT3G47590; hit=AT3G47590; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G47590` (AT3G47590) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823913] identity=62.1; qcov=0.885; evalue=2.5e-117; confidence=high
Rice	`Os01g0579900` - identity=55.2; qcov=0.841; evalue=1.64e-101; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00326 (Peptidase_S9); PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765959.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057765959.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057765959.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765959.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46046348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr1:46046942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:46048012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:46049057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B19,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765959.1

295 aa

148

295

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

Abhydrolase_1

Peptidase_S9

PF12146 Hydrolase_4 69-178 aa PF12697 Abhydrolase_6 72-172 aa PF00561 Abhydrolase_1 72-174 aa PF00326 Peptidase_S9 128-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765959.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	69	178	2.5e-16	60.4	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057765959.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	72	172	6.6e-07	30.9	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057765959.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	72	174	5.1e-12	46.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057765959.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	128	294	2e-05	24.9	Prolyl oligopeptidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909976.1
AAAATGGATATTCCTCAAAATGAACATACGCCTTAAATTACTTTTGATAAGATAAAACCAAAATTTATAGCATGGCCTCAAGGTTCTCTTTTTAGCACCGCATTTCAATTCCCACTATTAATCAACATATATATTTTTCTAAAATAAATAGAGTGATGAATTCGAATTTGGTGCTCACACACATGTCAATTCCGAACAAGAATCCACTCACGTTTCAGCGGGTCATATTTTCATCTTCCCGAATCAAGTTCAGAAGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986538
ATGAATTCGAATTTGGTGCTCACACACATGTCAATTCCGAACAAGAATCCACTCACGTTTCAGCGGGTCATATTTTCATCTTCCCGAATCAAGTTCAGAAGCAACCTCGTCGTAGCTCAAAGCCCAGGTATGCAGCAGAGAATAATAATACCGAACAAGCAAGGTCAAAAACTTGTTGGCGTGTTTCATGACACTGGATCAGAAAAACTTGCAGTTTTATGCCACGGCTTTCGGTCCTCAAAGGAGAGCAACATGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765959.1
MNSNLVLTHMSIPNKNPLTFQRVIFSSSRIKFRSNLVVAQSPGMQQRIIIPNKQGQKLVGVFHDTGSEKLAVLCHGFRSSKESNMMVNLAVALENEGISAFRFDFSGNGESEGPFEYGNYSGEREDLRAVVEYFTGVRRVPAAILGHSKGGSVVLLYASKYHDIGAVVNVCGRYDLKSGLERRLGENFMETLKKDGYIDVKTKTGAVSYRVTEKSLLERVNTNMHEACLSIDKGCRVLTVHGSADEVIPVDDALEFAKII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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