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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001878`

染色体: Chr05 坐标: 19037772-19039875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001878`
名称	SmilChr05G001878
描述	allene oxide synthase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19037772 - 19039875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986543`
GeneID	`130986543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986543`
原始查询	`LOC130986543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allene oxide synthase 1, chloroplastic
产物	allene oxide synthase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G42650` (AOS) allene oxide synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834273] identity=64.8; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0767000` (AOS1) - identity=63.1; qcov=0.882; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009695 (jasmonic acid biosynthetic process); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765966.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057765966.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057765966.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765966.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19038125`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr5:19038125`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr5:19038128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr5:19038171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr5:19038175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C14
`Chr5:19038382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B94,C54
`Chr5:19038482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B77,C25
`Chr5:19038554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C9
`Chr5:19038641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:19038660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr5:19038750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr5:19038750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765966.1

532 aa

266

532

p450

PF00067 p450 361-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765966.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	361	506	6.4e-12	45.7	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909983.1
TTTCTAGGAAAGCGGAATTCACCATACTTTTCTTCATTCGTAACTTTCCTACTATTCAATATTGTATTGGTAGCATTGGACGGCGCCGGTAATAGAGTAGAAATTTTCCGACCCATGTTTTTTATACTTGATCGCAAAATCACATTAATAATTATTTTTATTTTTATTTTATTATGCCCTCCCGTGTTTATTTATACCTCCAGAATAGTCAACTAAATCAATCAAACTCATTTCGTAGCAGTCAAAATCCTCATAACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986543
ATGGCTGCTTCGCATTCTCTCTCATCTCTCTCTCCTCCCCACCTCCAATTCTCTTCCCAAACCTCTACAAGAAAGCTACCCGCTTTCTCAAAACCCTTGAGGCCTCAGCCGATCATCACCGCCACCATATCCGAGAGACCATACATTTCACAGCCACTTCCGCCGCCACTGACGGCGGCGACGCCCTCCACGCTACCCATCCGCAAAATCCCGGGAGATTACGGGCTTCCCTTGATCGGGCCATGGAAGGACCGAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765966.1
MAASHSLSSLSPPHLQFSSQTSTRKLPAFSKPLRPQPIITATISERPYISQPLPPPLTAATPSTLPIRKIPGDYGLPLIGPWKDREDFFYKQGRDEFFKSRIKKYQSTVFRTNMPPGPFISFNPNVVALLDGKSFPALFDTDKVEKKDLFTGTYMPSVELTGGYRTLSFLDPSEPNHAKLKKLMFFMLSHRRDRVMPEFHSSYTELFDNLERELASKGKADFGPPSDQAAFNFLARSFFGVDPRDTKLGADGPKLVTKWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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