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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001889`

染色体: Chr05 坐标: 19193309-19202492 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001889`
名称	SmilChr05G001889
描述	protein DA1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19193309 - 19202492 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986552`
GeneID	`130986552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986552`
原始查询	`LOC130986552`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DA1-like
产物	protein DA1-like
Arabidopsis	`AT1G19270` (DA1) DA1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838510] identity=57.7; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0182500` - identity=62.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM); PF12315 (DA1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765976.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765976.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765976.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765976.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19196095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B49,B50,B84,C36
`Chr5:19197586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A5,B50,B85,C82
`Chr5:19200213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:19200528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C11,C45,C69
`Chr5:19202017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:19202191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765976.1

493 aa

246

493

LIM

DA1-like

PF00412 LIM 135-189 aa PF12315 DA1-like 284-487 aa

XP_057765977.1

493 aa

246

493

LIM

DA1-like

PF00412 LIM 135-189 aa PF12315 DA1-like 284-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765976.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	135	189	2.2e-09	38.1	LIM domain
`XP_057765976.1`	Pfam	`PF12315`	DA1-like	Family	284	487	1.2e-93	313.1	Protein DA1
`XP_057765977.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	135	189	2.2e-09	38.1	LIM domain
`XP_057765977.1`	Pfam	`PF12315`	DA1-like	Family	284	487	1.2e-93	313.1	Protein DA1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909993.1
AGTTGATGTTTCATTGTTTTTTTGAGGAGGAGAGTTGTTTTGTTTTGATAGTATTTCTTTTTTTTTGAAAGACTGTTGCTTTTGATAGTATTTCGTATTAGTCCACCGCTCGGGCTCTAAACTTAATTTGCTTATATCATAATATCTCATAAAACAAATATTTGTCTTACTTTGACTTTGAAATCTTGCTTTTCGCATTCACACTGTGCAACAAGTTTTTGCCACGCGATTTGTTTTGATTTTTTGATTGACTATTTGTA...

XM_057909994.1
AGGTCAGCTACTAGTCAAATACTTAATATTTTCCTTCTTTTCAATCATCTGTTCAAACGAAGCATCTGTATTCTCTCTGAATTTGTCTGTAGAAATTGAGCTGGATCAATCCATTGTTATGCAATCTGTGCCATTTGATTTTTGAAGTAAACACTTCATTGATTAATTCACATAATGGGCTGGCTTAGCAAAATCTTCAAGTGTTCAGACCATAAAGTTTTGGACGGGCATAGTGATTGGAGATATGGAGCGGATACTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986552
ATGGGCTGGCTTAGCAAAATCTTCAAGTGTTCAGACCATAAAGTTTTGGACGGGCATAGTGATTGGAGATATGGAGCGGATACTGCAGAGACTCATCAATCTGCATCATTGAATTCATGGAGAGAGACTGAAGATATAGACCGTGCTATTGCATTATCGCTTTCAGAGGAAGACGTGAAAGGAAAATCTACAGTTGAGAAAGAGCCACAATTGGAAGATGATGAACAACTGGCGAGGGCCCTCCAGGAGAGTTTGGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765976.1
MGWLSKIFKCSDHKVLDGHSDWRYGADTAETHQSASLNSWRETEDIDRAIALSLSEEDVKGKSTVEKEPQLEDDEQLARALQESLVVDSQPDSWSRNDTGNGYGYGSGYEYGYGYGNDNLYQPITFPYSTSFRICAGCNIEIGHGRFLSCMNALWHPQCFRCRGCNQPISDYEFSVSGSYPYHKTCYKESHHPKCDVCRHFIPTNAAGLIEYRAHPFWSQKYCPKHEHDGTPRCCSCERMESWDARYAALNDGRKLCLEC...

XP_057765977.1
MGWLSKIFKCSDHKVLDGHSDWRYGADTAETHQSASLNSWRETEDIDRAIALSLSEEDVKGKSTVEKEPQLEDDEQLARALQESLVVDSQPDSWSRNDTGNGYGYGSGYEYGYGYGNDNLYQPITFPYSTSFRICAGCNIEIGHGRFLSCMNALWHPQCFRCRGCNQPISDYEFSVSGSYPYHKTCYKESHHPKCDVCRHFIPTNAAGLIEYRAHPFWSQKYCPKHEHDGTPRCCSCERMESWDARYAALNDGRKLCLEC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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