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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001907`

染色体: Chr05 坐标: 19321781-19322948 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001907`
名称	SmilChr05G001907
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19321781 - 19322948 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986566`
GeneID	`130986566`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986566`
原始查询	`LOC130986566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
产物	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
Arabidopsis	`AT1G75030` (TLP-3) thaumatin-like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843841] identity=63; qcov=1; evalue=1.98e-113; confidence=high
Rice	`Os03g0233200` - identity=61.4; qcov=0.936; evalue=2.93e-91; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986566

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057765992.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057765992.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057765992.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765992.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19322099`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B112
`Chr5:19322099`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B112
`Chr5:19322137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:19322247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:19322281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:19322382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:19322463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:19322479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B112,B12,B16,D6
`Chr5:19322502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:19322572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B29,B94,C20,C76
`Chr5:19322604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr5:19322642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765992.1

249 aa

124

249

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 34-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765992.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	34	247	7.3e-82	274.8	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910009.1
GCTCGATTTTTCATTTTCAATTTCTCTCTTAATTCAGTAACACTTAACTGCCTTTCTTTCTCCATGAACTCTTCATGAGTACTCAAAGCAAATCTAATATTCTCAATTTTTAAAACTGACATTTGACGTGCAATAGTTGTTGTTGATCTTTCAATTTTTAAAAAGCATCAAAATATTAAAATAAGCGAAATTCAAGAAAATGTGAAACAACCGATTTCTCTCTCCGTGATTATAAATAGACAGATATTCATATGCAACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986566
ATGGTGGGCATATCGCAACCTCATCTCCTGCTTCTTCTTCTCCAGCTCTTCTCCATAGGGCTGTTGAGAATGGCCTCGGCGGCGCTATTCACTCTCCAAAACAGCTGCAGTTACACCGTCTGGCCCGGCACGATCTCCGGCAACGGCGCCGCCGTCCTCGGTGGCGGCGGCTTCGCATTGGCCCCCGGAGACACCGTCCAGCTCCCGGCCCCGGAGGGCTGGTCCGGGCGTTTCTGGGCCCGGACCGGGTGCAACTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765992.1
MVGISQPHLLLLLLQLFSIGLLRMASAALFTLQNSCSYTVWPGTISGNGAAVLGGGGFALAPGDTVQLPAPEGWSGRFWARTGCNFNDAGEGQCATGDCGGAIRCAGGGVPPVSLAEFTIGSGAGGKDFYDVSLVDGYNVGISVQPSGGSGDCQSAGCVADVNASCPEELQVVDGGGAVVACRSACSAFGTPEFCCTGAHASPDTCAPTAYSDMFKSACPAAYSYAYDDLSSTCTCTASDYFIIFCPST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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