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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001940`

染色体: Chr05 坐标: 19758001-19761517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001940`
名称	SmilChr05G001940
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19758001 - 19761517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986596`
GeneID	`130986596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986596`
原始查询	`LOC130986596`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
产物	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 18
Arabidopsis	`AT5G42990` (UBC18) ubiquitin-conjugating enzyme 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834314] identity=84.6; qcov=0.736; evalue=4e-75; confidence=high
Rice	`Os03g0681400` (OsUBC25) - identity=88; qcov=0.736; evalue=2.5e-77; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766029.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766029.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766030.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766030.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19758559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:19761094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,D10
`Chr5:19761118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:19761169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766029.1

161 aa

161

UQ_con

PF00179 UQ_con 19-154 aa

XP_057766030.1

159 aa

159

UQ_con

PF00179 UQ_con 19-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766029.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	19	154	9.1e-39	133.0	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057766030.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	19	127	2.4e-35	121.9	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910046.1
AGAAAATCTAAATTTATCCCAAGTGCAACTTAAACACAAAGCTTTTCAATATTATTATTATAATTATTATTTCTTGCACACAGACAAAAGGCCTAATTAATCTGCACACAAAACTTAAAAAACGCATCGTTTTAGCTCTCTTCCTCTCACAATTCTCTCACTCTGACGAGATGACCTCCGCTTCCGCTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAACCGGTTGCAGAAGGAGCTTGTAGAGTGGCAAGTGAAT...

XM_057910047.1
ACTTAAACACAAAGCTTTTCAATATTATTATTATAATTATTATTTCTTGCACACAGACAAAAGGCCTAATTAATCTGCACACAAAACTTAAAAAACGCATCGTTTTAGCTCTCTTCCTCTCACAATTCTCTCACTCTGACGAGATGACCTCCGCTTCCGCTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAACCGGTTGCAGAAGGAGCTTGTAGAGTGGCAAGTGAATCCACCAGCCGGTTTCAAGCATAAAGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986596
ATGACCTCCGCTTCCGCTTCCTCACGCAAGGCATTGAGCAAGATCGCGTGCAACCGGTTGCAGAAGGAGCTTGTAGAGTGGCAAGTGAATCCACCAGCCGGTTTCAAGCATAAAGCTACTGATAATCTCAAGAGATGGGTAATTGAAGTCAACGGGGCGTCGGGCACGCTCTATGCCGGTGAAATGTACCAACTTCAAGTTGATTTTCCGGAGCATTACCCCATGGAAGCGCCACAGGTTATATTTGTGCCTCCGGCTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766029.1
MTSASASSRKALSKIACNRLQKELVEWQVNPPAGFKHKATDNLKRWVIEVNGASGTLYAGEMYQLQVDFPEHYPMEAPQVIFVPPAPMHPHIYSNGHICLDILYDSWSPAMTVSSICISILSMLSSSTVKQRPADNDRYVRNCKNGRSPKETRWWFHDDKV

XP_057766030.1
MTSASASSRKALSKIACNRLQKELVEWQVNPPAGFKHKATDNLKRWVIEVNGASGTLYAGEMYQLQVDFPEHYPMEAPQVIFVPPAPMHPHIYSNGHICLDILYDSWSPAMTVSSICISILSMLSSSTVKLTMIGMLGTVRMVGLLRRRDGGSTTIKCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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