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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001948`

染色体: Chr05 坐标: 19844787-19847049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001948`
名称	SmilChr05G001948
描述	thioredoxin H-type 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19844787 - 19847049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986605`
GeneID	`130986605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986605`
原始查询	`LOC130986605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H-type 1-like
产物	thioredoxin H-type 1-like
Arabidopsis	`AT3G51030` (TRX1) thioredoxin H-type 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824267] identity=62.8; qcov=0.926; evalue=1.34e-51; confidence=high
Rice	`Os07g0186000` (TRXH) - identity=61.2; qcov=0.992; evalue=1.85e-51; confidence=high
GO	GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF14595 (Thioredoxin_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766042.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766042.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057766042.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766042.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19844955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:19844960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B105,B16,B35,C62
`Chr5:19845048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:19845628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B49,B70,C28,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766042.1

122 aa

122

Thioredoxin

Thioredoxin_2

Thioredoxin_9

PF00085 Thioredoxin 19-110 aa PF13098 Thioredoxin_2 28-112 aa PF14595 Thioredoxin_9 30-93 aa

XP_057766043.1

122 aa

122

Thioredoxin

Thioredoxin_2

Thioredoxin_9

PF00085 Thioredoxin 19-110 aa PF13098 Thioredoxin_2 28-112 aa PF14595 Thioredoxin_9 30-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766042.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	19	110	6.3e-30	103.9	Thioredoxin
`XP_057766042.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	28	112	1.3e-09	39.1	Thioredoxin-like domain
`XP_057766042.1`	Pfam	`PF14595`	Thioredoxin_9	Family	30	93	1.4e-05	25.7	Thioredoxin
`XP_057766043.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	19	110	6.3e-30	103.9	Thioredoxin
`XP_057766043.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	28	112	1.3e-09	39.1	Thioredoxin-like domain
`XP_057766043.1`	Pfam	`PF14595`	Thioredoxin_9	Family	30	93	1.4e-05	25.7	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910060.1
ATGCAAAGTTATGCTTAAAATCGTGGTCGACATACAACGACTTCTCGAACATTTCAAACGTAGCACGCTATCCTCTCCAGGGCATATCCGTAATTATGTCCAAGAAAAGGCCTTTCCTCGTCAATTCGCATCCTTGATTTTGGGCTTATAAAAAGCACCGCTTTGGCTTATTCCCTGCTTACACCAAACGCATTGTTTTACGATACATTTGAGAGAGAAAATCTCGTGAATTTCCCAAGACTAGAGAGAGAAAATGGCTT...

XM_057910059.1
CGTGGTCGACATACAACGACTTCTCGAACATTTCAAACGTAAGTCTTATCCTGCAAGATTTCTTCGTCACGTAGAGTCGTGATTTGCAATTGCTAGTGAAAATCGATTGTTGCATCATTGCATAGGTAGCACGCTATCCTCTCCAGGGCATATCCGTAATTATGTCCAAGAAAAGGCCTTTCCTCGTCAATTCGCATCCTTGATTTTGGGCTTATAAAAAGCACCGCTTTGGCTTATTCCCTGCTTACACCAAACGCATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986605
ATGGCTTCCGTTGAAGAGGGACAGGTGATTTCTTGCCACTCCGTCGACGAGTGGAAGGAGCATTTCCAGAAGGGTGTCGACTCCAACAAACTGGTGGTAGTGGATTTCACAGCTTCATGGTGTGGGCCATGCCGCTTCATTGCTCCTATTCTGGCCGAGATAGCCAAGAAGACACCCCATGTTATATTCTTGAAGGTGGACGTTGATGAGCTTAAGACTGTAGCTCAGGAGTACAACATTGAGGCGATGCCGTCATTTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766042.1
MASVEEGQVISCHSVDEWKEHFQKGVDSNKLVVVDFTASWCGPCRFIAPILAEIAKKTPHVIFLKVDVDELKTVAQEYNIEAMPSFLFIKEGKEIDRVVGARKEDLLAKVTQHGGAALTASA

XP_057766043.1
MASVEEGQVISCHSVDEWKEHFQKGVDSNKLVVVDFTASWCGPCRFIAPILAEIAKKTPHVIFLKVDVDELKTVAQEYNIEAMPSFLFIKEGKEIDRVVGARKEDLLAKVTQHGGAALTASA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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