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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001953`

染色体: Chr05 坐标: 19976654-19979782 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001953`
名称	SmilChr05G001953
描述	transcription initiation factor IIF subunit beta
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19976654 - 19979782 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986610`
GeneID	`130986610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986610`
原始查询	`LOC130986610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor IIF subunit beta
产物	transcription initiation factor IIF subunit beta
Arabidopsis	`AT1G75510` (AT1G75510) Transcription initiation factor IIF, beta subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843887] identity=67.5; qcov=1.01; evalue=6.58e-126; confidence=high
Rice	`Os05g0509900` (OsTFIIF2-1) - identity=67.2; qcov=0.958; evalue=1.43e-121; confidence=high
GO	GO:0005674 (transcription factor TFIIF complex); GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02270 (TFIIF_beta); PF17683 (TFIIF_beta_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766048.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766048.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766048.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766048.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19976917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,D10
`Chr5:19979342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:19979525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C65,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766048.1

264 aa

132

264

TFIIF_beta_N

TFIIF_beta

PF17683 TFIIF_beta_N 19-136 aa PF02270 TFIIF_beta 190-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766048.1`	Pfam	`PF17683`	TFIIF_beta_N	Family	19	136	3.4e-08	34.8	TFIIF, beta subunit N-terminus
`XP_057766048.1`	Pfam	`PF02270`	TFIIF_beta	Domain	190	254	2e-21	76.6	TFIIF, beta subunit HTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910065.1
GAAAAGGAAAGAAAACGAGAATCACTTAAAACTGAAAGCGCTAAAAACTAAAAAGTGTTAGTTGATTTATAAATACGGATTGAAAGAATTGAAACAAGGAAGAAACGCAGAAGACAAAGATCCACCGATATCCAGTTACCCGACCAATTGTGATCCGACCCGTCACCGTAGAGTCCAATTTCAGTCGTTACATAAATCTATTCAGACGAAACCCGTTAACGCTCCGTCAGAAACTCGAGGATTCCGTCAATGGAGGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986610
ATGGAGGACGACCACAGTAATGGCGACATCAACGTCGAAACCTCCAAAGCCGACCGATCGGTGTGGCTCATGAAGTGCCCTCCCATCGTCTCCAAGGCCTGGCAGTCCTCCGCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGTCGACTCGCCGCCCGTCGCCAAAGTCGTGGTTTCTCTCGATCTCCTCCAGCCGGATGACTCCTCCGCCCTCCAATTTACTATGGAGATGGCTGGGAGTGAGATTGCGAATATGCCGAAGAGTTACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766048.1
MEDDHSNGDINVETSKADRSVWLMKCPPIVSKAWQSSAASASASVDSPPVAKVVVSLDLLQPDDSSALQFTMEMAGSEIANMPKSYSLNMSKDFVPMGIFSESTQGRVAMEGKVEHKFDMKPHHANIEEYRKMCRERTNKSMVKNRQIQVINNDRGVHMRPMPGMMGLITSTSKDKKKPAPVKGSDVKRTRRDRGELEDIMFKLFERQPNWTLKQLVQETDQPAQFLKEILNELCVYNKRGTNQGTYELKPEYKKSVEDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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