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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001959`

染色体: Chr05 坐标: 20102755-20109047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001959`
名称	SmilChr05G001959
描述	coatomer subunit alpha-1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20102755 - 20109047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986613`
GeneID	`130986613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986613`
原始查询	`LOC130986613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit alpha-1-like
产物	coatomer subunit alpha-1-like
Arabidopsis	`AT1G62020` (AT1G62020) Coatomer, alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842497] identity=82.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0127800` (OsWD40-165) - identity=78.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030126 (COPI vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF04053 (B-prop_COPA_B_2nd); PF06957 (COPI_C); PF23953 (TPR_COPA_B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766053.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766053.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766053.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766053.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20103254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B1,B68,D10
`Chr5:20103275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B80
`Chr5:20103469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:20103560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C2
`Chr5:20103656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B96
`Chr5:20103709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:20104142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C56
`Chr5:20104265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C59
`Chr5:20104540`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr5:20104540`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr5:20105243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:20105427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766053.1

1218 aa

609

1218

WD40

B-prop_COPA_B_2nd

TPR_COPA_B

COPI_C

PF00400 WD40 42-79 aa PF00400 WD40 84-121 aa PF00400 WD40 126-163 aa PF00400 WD40 198-231 aa PF00400 WD40 241-276 aa PF04053 B-prop_COPA_B_2nd 340-584 aa PF23953 TPR_COPA_B 626-767 aa PF06957 COPI_C 815-1218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	42	79	3.4e-49	163.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	84	121	3.4e-49	163.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	126	163	3.4e-49	163.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	198	231	3.4e-49	163.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	241	276	3.4e-49	163.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF04053`	B-prop_COPA_B_2nd	Repeat	340	584	5.9e-69	233.0	COPA/B second beta-propeller
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF23953`	TPR_COPA_B	Repeat	626	767	1.1e-17	65.0	COPA/B TPR domain
`XP_057766053.1`	Pfam	`PF06957`	COPI_C	Repeat	815	1218	4.7e-170	566.4	Coatomer (COPI) alpha subunit C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910070.1
AACATCTCAAACCATTGTTCAGAACATTAATCCAGTACTGGTTGGGCGAGTAGAGTAGATCTACAGCAAGCGCAAAGAAATAACGCACTCTCTTTAACCTACACCCCCCTTTCTTATCCCACACCCATGTCGTTAAAAATCCCCAATTTTTCACAGATCTAAATCTCGATCAGGGTTTCCAAATTCTGGCACTAACCTCAGATCTCTCCATTCCTTCACCGTGCGCGATCATAGGTGGAGAGACGATTGGCCCAAAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986613
ATGCTGACGAAATTCGAGACCAAGAGCAATCGAGTGAAAGGCTTGAGCTTTCACAGCAAGCGCCCATGGATCCTCGCAAGTCTTCACAGCGGCGTGATCCAGCTCTGGGATTACCGCATGGGCACCCTCATCGACCGATTCGATGAGCACGACGGGCCTGTTCGCGGCGTTCATTTCCACAAATCGCAGCCGCTTTTCGTCTCCGGAGGTGATGATTACAAAATTAAGGTGTGGAATTATAAATTGCATAGATGTCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766053.1
MLTKFETKSNRVKGLSFHSKRPWILASLHSGVIQLWDYRMGTLIDRFDEHDGPVRGVHFHKSQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLHRCLFTLLGHLDYIRTVQFHHEYPWIVSASDDQTIRIWNWQSRTCISVLTGHNHYVMCASFHPKEDLVVSASLDQTVRVWDIGALRKKTVSPADDILRLSQMNADFFGGVDAVVKYVLEGHDRGVNWASFHPTLPLIVSGADDRQVKIWRMNDTKAWEVDTLRGHMNNVSCVLFHARQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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