当前解析结果
SmilChr05G001965| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001965 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001965 |
| 描述 | glycine-rich RNA-binding, abscisic acid-inducible protein |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 20222571 - 20223475 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986618 |
|---|---|
| GeneID | 130986618 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986618 |
| 原始查询 | LOC130986618 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich RNA-binding, abscisic acid-inducible protein |
| 产物 | glycine-rich RNA-binding%2C abscisic acid-inducible protein |
| Arabidopsis | AT1G75550 (AT1G75550)glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843891] identity=39.1; qcov=1.03; evalue=2.22e-07; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986618 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057766059.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766059.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766059.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766059.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766059.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:20223089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B121 |
Chr5:20223112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:20223219 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr5:20223244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B13 |
Chr5:20223250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C45,C61,C85 |
Chr5:20223251 |
T |
TCG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 9 | A11,B135,B68,B72,B93,C46,C48,C83,D1 |
Chr5:20223276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr5:20223331 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr5:20223360 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B88,C20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。