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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001967`

染色体: Chr05 坐标: 20229411-20233057 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001967`
名称	SmilChr05G001967
描述	tryptophan N-monooxygenase CYP79A68-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20229411 - 20233057 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986621`
GeneID	`130986621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986621`
原始查询	`LOC130986621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan N-monooxygenase CYP79A68-like
产物	tryptophan N-monooxygenase CYP79A68-like
Arabidopsis	`AT5G05260` (CYP79A2) phenylalanine N-monooxygenase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830408] identity=53; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0171800` - identity=51.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766061.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057766061.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766061.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766061.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20229672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C61,C85
`Chr5:20229701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B16
`Chr5:20229727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:20229769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A18,B105,B19,B50,C43
`Chr5:20229769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B105,B19,B50,C43
`Chr5:20229948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B52,C29,C47
`Chr5:20229969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A21
`Chr5:20229969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:20229975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:20230010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:20230041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B113,B27,C82,D5
`Chr5:20230265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766061.1

524 aa

262

524

p450

PF00067 p450 38-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766061.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	38	494	2.3e-79	268.0	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910078.1
CTCTATAAAAGCCGAAATATAAACCCGTGAAGCTGACAACATTCAAACACGAGAAATTAACAACCATGAAAATGGAAACAAGCTTTCCATCGTTGCTTGCAATATTATCTTTAGTTTCCCTAATCTTCTTGAAACTCATATATTCCACCATGAAAAGATCGACGGCGCCACCGCTGCCACCGGGGCCGGCTGCCTACCCGGTGGTGGGCAGCCTGCCGGAAATGCTGTTGAAGAAGCCCGCATTCCGATGGATACACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986621
ATGAAAATGGAAACAAGCTTTCCATCGTTGCTTGCAATATTATCTTTAGTTTCCCTAATCTTCTTGAAACTCATATATTCCACCATGAAAAGATCGACGGCGCCACCGCTGCCACCGGGGCCGGCTGCCTACCCGGTGGTGGGCAGCCTGCCGGAAATGCTGTTGAAGAAGCCCGCATTCCGATGGATACACAATGTCATGCAAAAACTCAACACGGAGATCGTCTGCATCCGCCTCGGCAGCGTCCACGTCATCGCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766061.1
MKMETSFPSLLAILSLVSLIFLKLIYSTMKRSTAPPLPPGPAAYPVVGSLPEMLLKKPAFRWIHNVMQKLNTEIVCIRLGSVHVIAVSSPELSREFLKKHDAILASRPDSVSARLTSDGYLTPALSPAGDQWKKMRRVMVSEVLTMGVFRRLHSKRCEEADHLVRYVYNHRNGVVNVRDAARHYCTNLIKKMVFGERFFGPGMEDGGPGNEDREHVDGLFTIISCLYGFALADFVPWLEVFDLDGHKRIVRNAIKKVRKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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