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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001969`

染色体: Chr05 坐标: 20322994-20325084 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001969`
名称	SmilChr05G001969
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20322994 - 20325084 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986623`
GeneID	`130986623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986623`
原始查询	`LOC130986623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
产物	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
Arabidopsis	`AT1G19910` (AVA-P2) ATPase, F0/V0 complex, subunit C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838579] identity=98.2; qcov=1; evalue=1.63e-111; confidence=high
Rice	`Os12g0168900` - identity=98.2; qcov=1; evalue=6.34e-111; confidence=high
GO	GO:0033179 (proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00137 (ATP-synt_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057766064.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057766064.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057766064.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057766064.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057766064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20323350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C58
`Chr5:20324414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:20324415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C35,C71
`Chr5:20324433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C71
`Chr5:20324445`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A10,A11,A13,B115,B134,B135,B41,B54,B73,C12,C15,C33,C38,C40,C50,C52,C69
`Chr5:20324519`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B115,B13,B134,B41,B54,B73,B87,C12,C15,C33,C35,C43,C52,C71
`Chr5:20324540`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr5:20324540`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr5:20324542`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr5:20324542`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr5:20324554`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B115,B13,B134,C12,C43,C52
`Chr5:20324573`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B130,B134,B26,B29,B73,B87,B96,C15,C43,C50,C60,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766064.1

165 aa

165

ATP-synt_C

PF00137 ATP-synt_C 17-76 aa PF00137 ATP-synt_C 97-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766064.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	17	76	4.4e-34	117.2	ATP synthase subunit C
`XP_057766064.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	97	155	4.4e-34	117.2	ATP synthase subunit C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910081.1
CAAGTAGGCTATCAAGTAAGCCCATTGCGGATGCTCTAATAGCGATTTGAGGGGTAAAAATGTAATTGAGAGACGAATCGATGTGATGGAGAGGCCCTCCACTCCGCAATCCAATCAACCAGATAGATGCATATAATAATGAAGCTCTAAAATACGTACAACAATCCTCTCTCTCTGCGAAGTCTCGACCAAAAACCAGAGAAGATCATCTCAGATCCGATCTTTGCAGGAATCCAAACCGATCGAAAATGTCGTCTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986623
ATGTCGTCTACCTTCAGCGGCGATGAAACGGCACCGTTCTTCGGCTTTCTCGGCGCCGCCGCCGCTCTAGTCTTCTCCTGTATGGGAGCGGCGTACGGCACCGCCAAGAGCGGCGTCGGAGTGGCGTCGATGGGCGTGATGAGGCCGGAGCTGGTGATGAAGTCTATTGTTCCGGTGGTCATGGCTGGTGTTTTGGGTATTTACGGTTTGATTATTGCTGTGATTATTAGCACCGGTATTAACCCTAAGGCCAAGTCTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766064.1
MSSTFSGDETAPFFGFLGAAAALVFSCMGAAYGTAKSGVGVASMGVMRPELVMKSIVPVVMAGVLGIYGLIIAVIISTGINPKAKSYYLFDGYAHLSSGLACGLAGLAAGMAIGIVGDAGVRANAQQPKLFVGMILILIFAEALALYGLIVGIILSSRAGQSRAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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