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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001974`

染色体: Chr05 坐标: 20380018-20380993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001974`
名称	SmilChr05G001974
描述	histone H3.3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20380018 - 20380993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986627`
GeneID	`130986627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986627`
原始查询	`LOC130986627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H3.3
产物	histone H3.3
Arabidopsis	`AT4G40030` (AT4G40030) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830164] identity=100; qcov=1; evalue=1.39e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0390600` (H3) - identity=100; qcov=1; evalue=9.47e-97; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766068.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057766068.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057766068.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766068.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20380219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:20380225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:20380285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B114,B17,B73,C30
`Chr5:20380330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:20380335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A19,B52,B86
`Chr5:20380335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B52,B86
`Chr5:20380390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B120,B18,B48,C24
`Chr5:20380438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B93,C20
`Chr5:20380449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	218	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr5:20380581`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A8
`Chr5:20380581`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A8
`Chr5:20380593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B133,B75,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766068.1

136 aa

136

Histone

PF00125 Histone 44-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766068.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	44	131	8.2e-39	132.6	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910085.1
CAAGTCACGGATCCTCACGACTTCTCAAATTGCCGTTGTAAAAAAGACAATAACTCCACGTTTCAAAACAGACCTACACCCCACCCCCTATATATACCCCCGCCCCTCTAAATTTTTGCGATAAGCACCAAGTTTCTGAATTTTCAAATTCTCAAGTGATGGCTCGTACGAAGCAGACCGCTCGTAAATCTACCGGTGGAAAGGCCCCAAGGAAGCAGCTTGCTACCAAGGCTGCGAGGAAATCAGCTCCGACTACCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986627
ATGGCTCGTACGAAGCAGACCGCTCGTAAATCTACCGGTGGAAAGGCCCCAAGGAAGCAGCTTGCTACCAAGGCTGCGAGGAAATCAGCTCCGACTACCGGCGGAGTGAAGAAGCCCCACCGCTACCGCCCTGGAACCGTCGCTCTTCGTGAAATCCGGAAATACCAGAAGAGCACGGAGCTTCTAATCCGCAAGCTACCGTTCCAGCGATTGGTTCGTGAAATCGCTCAGGATTTCAAGACTGATTTGAGGTTCCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766068.1
MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPTTGGVKKPHRYRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSHAVLALQEAAEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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