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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002013`

染色体: Chr05 坐标: 20871396-20875137 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002013`
名称	SmilChr05G002013
描述	synaptotagmin-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20871396 - 20875137 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986655`
GeneID	`130986655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986655`
原始查询	`LOC130986655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	synaptotagmin-2-like
产物	synaptotagmin-2-like
Arabidopsis	`AT1G20080` (SYTB) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838597] identity=69.8; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0448400` (OsNTMC2T1.1) - identity=67; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF17047 (SMP_LBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766101.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766102.1`
3	Membrane raft	膜筏	0.20000	`XP_057766102.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766101.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20871646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B74,B77,B79
`Chr5:20871679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:20871769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C75
`Chr5:20871769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:20871869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:20871988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:20872017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:20872038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr5:20872111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:20872139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B88
`Chr5:20872147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B62,C34
`Chr5:20872216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B87,C22,C5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766101.1

540 aa

270

540

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 67-248 aa PF00168 C2 260-358 aa PF00168 C2 418-522 aa

XP_057766102.1

525 aa

262

525

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 52-233 aa PF00168 C2 245-343 aa PF00168 C2 403-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766101.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	67	248	5.3e-17	62.6	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057766101.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	260	358	7.3e-40	136.1	C2 domain
`XP_057766101.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	418	522	7.3e-40	136.1	C2 domain
`XP_057766102.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	52	233	5e-17	62.7	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057766102.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	245	343	6.5e-40	136.3	C2 domain
`XP_057766102.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	403	507	6.5e-40	136.3	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910119.1
TCCAAATATTGCACATGTCGATGATGCTATTTTATTACATAGTACTAGTTAAAATAGTTACAGAAAACCGTTATGTATGGATCCACCATGGGTCGTTGAATGCAAGGAGAGGGAGCCATTTATGTTACCCTTTATCACATCTGATCCTGAAGTCCGTCCATTAGTCGAGCAATCTTATGAATTTCTCCAAACTCTTCTTCCAGAAATACCACTTTGGATAAAAAATCCAGATTATGATCGACTGGACTGGTTGAACAAAT...

XM_057910118.1
CTTTCGTTTGCCATTGTGATATCCTTCGTACTTGTTTTATTTTTTTACAAAAAATATAGTAATTAATCCATTTTGATGAAGCCCCTTTACGATATAATTAATGTAATATTGGCCCATTTGGTTCTTGAATTTGAGTCCCTTTTCTTGATCAAGATTCTTAGAGACAATTGTTTTTGAAAATTTATGTGGTTTGTGCGTTGATCGGTGGAATTGTTTGAGAGAATTCTTGATATAAGTAAGATTAGAGATGGGTTTTGTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986655
ATGGATCCACCATGGGTCGTTGAATGCAAGGAGAGGGAGCCATTTATGTTACCCTTTATCACATCTGATCCTGAAGTCCGTCCATTAGTCGAGCAATCTTATGAATTTCTCCAAACTCTTCTTCCAGAAATACCACTTTGGATAAAAAATCCAGATTATGATCGACTGGACTGGTTGAACAAATTCATAGAATGTATGTGGCCTTATTTAGATAAGGCCATATGCAAGACAGTAAAACAGATCGCGGAGCCTATTATAGC...

LOC130986655
ATGGGTTTTGTAAGCACAATATTGGGCATGATTGGTTTTGGGATGGGTTTTTCAGCTGGGCTTGTGGCTGGATATTTCTTGTTAATCTACTTTCTGCCAAATGATGTAAAGGATCCTGAAGTCCGTCCATTAGTCGAGCAATCTTATGAATTTCTCCAAACTCTTCTTCCAGAAATACCACTTTGGATAAAAAATCCAGATTATGATCGACTGGACTGGTTGAACAAATTCATAGAATGTATGTGGCCTTATTTAGATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766101.1
MGFVSTILGMIGFGMGFSAGLVAGYFLLIYFLPNDVKDPEVRPLVEQSYEFLQTLLPEIPLWIKNPDYDRLDWLNKFIECMWPYLDKAICKTVKQIAEPIIAEQIPQYKIDAVEFEQLTLGGLPPTFQGMKVYSTEEKELMMELGLKWAGTPNILVAVKAFGLKATAQVIDFQVFASPRITLKPLVPTFPCFANIYVSLMEKPHVDFGVKLLGADAMSIPGAYRMVQEIIKDQVANMYLWPKRLEVQIMDPMKAMQRPVG...

XP_057766102.1
MDPPWVVECKEREPFMLPFITSDPEVRPLVEQSYEFLQTLLPEIPLWIKNPDYDRLDWLNKFIECMWPYLDKAICKTVKQIAEPIIAEQIPQYKIDAVEFEQLTLGGLPPTFQGMKVYSTEEKELMMELGLKWAGTPNILVAVKAFGLKATAQVIDFQVFASPRITLKPLVPTFPCFANIYVSLMEKPHVDFGVKLLGADAMSIPGAYRMVQEIIKDQVANMYLWPKRLEVQIMDPMKAMQRPVGILNVNVVRAMNLKKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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