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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G002047

染色体: Chr05 坐标: 21288760-21292660 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G002047
名称SmilChr05G002047
描述protein FMP32, mitochondrial-like
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向21288760 - 21292660 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130986684
GeneID130986684
locus_tag-
NCBI NameLOC130986684
原始查询LOC130986684

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述protein FMP32, mitochondrial-like
产物protein FMP32%2C mitochondrial-like
ArabidopsisAT2G16460 (AT2G16460)
coiled-coil 90B-like protein (DUF1640) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816144]
identity=77.6; qcov=0.901; evalue=1.88e-108; confidence=high
RiceOs06g0713100
-
identity=66.5; qcov=1.07; evalue=6.98e-108; confidence=high
GOGO:0005739 (mitochondrion)
KEGG-
PfamPF07798 (CCDC90-like)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130986684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 1.00000 XP_057766137.1
2 Mitochondrion membrane 线粒体膜 0.80000 XP_057766137.1
3 Mitochondrion inner membrane 线粒体内膜 0.80000 XP_057766137.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057766137.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057766137.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766137.1
213 aa
N
1
106
213
CCDC90-like
C
PF07798 CCDC90-like 38-211 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057766137.1 Pfam PF07798 CCDC90-like Family 38 211 3.1e-57 193.9 Coiled-coil domain-containing protein 90-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057910154.1
AGACAGGAAAAAAACACGCTGGAACAAAAGTTGAACGCCATTTTTGAATTCTTGATTTTCTTTTATTTCCGCAGCAGTAGTTGCTTATAAATAATGCCAACCTCCAGCACAAAAAGGGTGTCAAACCCAACTTCCAATCCAGTTATCAATTCTCACGTTTTTCTAGGAAAACTTCTCCTCACCTTCCTCTTTCGATCTTCATTTTACTTGTTTCTCTCTTTAATTCCGCCCCATTTTGTTGATAGCTCGCAAGATTAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130986684
ATGACCGCATACGCGGCGGCGTGTAAGCGGGTTCTGAGATTGGGACCCGCGTTGGTCGGAACCCGACCCATTTCCGAGCTTGCTAAATCCAACGGCAAACGGGTCTACCTCGTCGACACTCTGGCCCTTGTGAGGAAATTGGAGGCCCAGGGGGTGGAGTCGAGGCAGGCGCAGGCGATAACAGAGGCGATGATGGAGGTGCTGAATGATAGCATGGAGAATGTTTCTGGTTCCTATGTTTCAAAGAGTGAAATGCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057766137.1
MTAYAAACKRVLRLGPALVGTRPISELAKSNGKRVYLVDTLALVRKLEAQGVESRQAQAITEAMMEVLNDSMENVSGSYVSKSEMQKSEMFQENNLSMFKTEVKSSQDHHFSMLQHEMEKIKNDIEKMRSELRYEIDKVTAGQRLDLNLERGRIRDELNNQNQETTNLTTKLDREIHTLRAQLEAAKYDVIKYCIGTLASVSAVGLAVIRILM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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