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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002085`

染色体: Chr05 坐标: 21779712-21784865 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002085`
名称	SmilChr05G002085
描述	3-epi-6-deoxocathasterone 23-monooxygenase CYP90C1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21779712 - 21784865 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986714`
GeneID	`130986714`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986714`
原始查询	`LOC130986714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-epi-6-deoxocathasterone 23-monooxygenase CYP90C1
产物	3-epi-6-deoxocathasterone 23-monooxygenase CYP90C1
Arabidopsis	`AT4G36380` (ROT3) Cytochrome P450 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829790] identity=69.3; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0197100` (D2) - identity=52.2; qcov=0.908; evalue=9.74e-172; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0007275 (multicellular organism development); GO:0010268 (brassinosteroid homeostasis); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016132 (brassinosteroid biosynthetic process); GO:0016709 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00905 (Brassinosteroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986714

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766177.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057766177.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766177.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766177.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21780269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B16
`Chr5:21780305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C9
`Chr5:21780331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:21780569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:21781015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B28,C14,C47
`Chr5:21782072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:21782073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B65,C14,C60
`Chr5:21782104`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B3,C6,C79
`Chr5:21782104`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B3,C6,C79
`Chr5:21782160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,A6,B82,C78
`Chr5:21782263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B125,B67,C19,C24
`Chr5:21782738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766177.1

489 aa

244

489

p450

PF00067 p450 44-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766177.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	44	464	4e-55	188.1	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910194.1
TGCAATTCTTATAATATGGTTACCATATACAGTTAAACATGTTATTCGATACAAAATACAATATACTTTAATATATTAAATCTTTTAGTATATAATAATCAACATTTAGTATTACTCGGTTCAACTTTCTCCCCATCAATTCCCTTGGTAACCAGTGCGTGTCTCAGTGTGTATATATATATATATATCTGCTGCTCAGCATATAAAGAAGCAATCTTTCGAATAATTAGCAGAAAACATTTTCGAATTTCTTGAAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986714
ATGGAGTGGTTAAGTTTGGAAGGGTACTGGGCTTTGATGGCGATTTCAGTGTGTGTAGTGTGTGTGTGGGTGACGAAGAAGAGAGAGGAAAAGGGTGTTTTAGAGAGTGATGGAGAGCGCTTCGTGGTTCCAAGAGGGAGCTGGGGTTGGCCATTGATAGGGGAAACGTTTGAGTTTATTGCATCTGGTTACACCTCCACGCCCGTCAGCTTCATGGAAAAGCGCAAATCTCTGTATGGAGGTGTTTTTAGAACACACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766177.1
MEWLSLEGYWALMAISVCVVCVWVTKKREEKGVLESDGERFVVPRGSWGWPLIGETFEFIASGYTSTPVSFMEKRKSLYGGVFRTHILGKAIVVSTDPDVSKVILQNHGNAFVPCYPKSITELLGKSSILQINGALHKRLHALIGVFLKSTQLKNRITRDVEKIVRLSLSSWMDKSCQVYVQDETKKITFQILVRVLMSIGPGDEMECLKREFEEFIKGLICLPVNLPGTRLYKSLKAKERLLKVVDKIVEARKTAMEEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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