当前解析结果
SmilChr05G002092| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002092 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002092 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002092 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 21894655 - 21897049 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986722 |
|---|---|
| GeneID | 130986722 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986722 |
| 原始查询 | LOC130986722 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | thiamine-phosphate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835001]; symbol=AT5G49410; hit=AT5G49410; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | thiamine-phosphate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835001]; symbol=AT5G49410; hit=AT5G49410; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G49410 (AT5G49410)thiamine-phosphate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835001] identity=84.5; qcov=0.758; evalue=2.01e-58; confidence=high |
| Rice | Os08g0360000- identity=71.4; qcov=0.875; evalue=4.28e-57; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986722 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057766196.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 0.40000 | XP_057766196.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057766196.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057766196.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766196.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:21894878 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A18,A7,B101,B94 |
Chr5:21894896 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,C7 |
Chr5:21894898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B138,B45,B79,C82 |
Chr5:21894911 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,A7,B101,B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。