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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002128`

染色体: Chr05 坐标: 22373997-22382509 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002128`
名称	SmilChr05G002128
描述	uncharacterized SmilChr05G002128
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22373997 - 22382509 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986750`
GeneID	`130986750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986750`
原始查询	`LOC130986750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821973]; symbol=AT3G23900; hit=AT3G23900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821973]; symbol=AT3G23900; hit=AT3G23900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G23900` (AT3G23900) RNA recognition motif (RRM)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821973] identity=59.8; qcov=0.91; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0101600` - identity=52.5; qcov=0.936; evalue=6.1e-158; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00630 (Filamin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766237.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766239.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057766237.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766237.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22376827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C32,C68
`Chr5:22376895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:22376908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,A6,B82,C78
`Chr5:22377116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:22377206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:22377454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A21,A6,C78
`Chr5:22377455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:22377492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:22377626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:22377743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B71,D11
`Chr5:22379202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:22379465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766237.1

834 aa

417

834

Filamin

RRM_1

PF00630 Filamin 89-187 aa PF00076 RRM_1 354-414 aa

XP_057766239.1

832 aa

416

832

Filamin

RRM_1

PF00630 Filamin 89-187 aa PF00076 RRM_1 352-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766237.1`	Pfam	`PF00630`	Filamin	Domain	89	187	7.1e-20	72.4	Filamin/ABP280 repeat
`XP_057766237.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	354	414	1.2e-11	45.0	RNA recognition motif
`XP_057766239.1`	Pfam	`PF00630`	Filamin	Domain	89	187	7e-20	72.4	Filamin/ABP280 repeat
`XP_057766239.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	352	412	1.2e-11	45.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

20 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089366.1
CCTAGTAGAATTAAAGAAAAGGCTTTATCCAAATTTCAATATCCCCCGCGACCCTCAATCCCCAATTCTTTACTACACGCTTTCCCGCACTGAATCTCTCTCTAAATTAGGTCAAAATATTCGGCAATTTCGAATTAGGGTTCGGCCATTAGTGCAAAGCTGCCCTAACAAATGGCCGGGAACAACACTACAGCTAACAGCAACAATCAAGTTACGGCGGTGCCGACGGTGCCGAAGACCATATGGATGAAGCAAGCGGA...

XR_009089371.1
CCTAGTAGAATTAAAGAAAAGGCTTTATCCAAATTTCAATATCCCCCGCGACCCTCAATCCCCAATTCTTTACTACACGCTTTCCCGCACTGAATCTCTCTCTAAATTAGGTCAAAATATTCGGCAATTTCGAATTAGGGTTCGGCCATTAGTGCAAAGCTGCCCTAACAAATGGCCGGGAACAACACTACAGCTAACAGCAACAATCAAGTTACGGCGGTGCCGACGGTGCCGAAGACCATATGGATGAAGCAAGCGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986750
ATGGCCGGGAACAACACTACAGCTAACAGCAACAATCAAGTTACGGCGGTGCCGACGGTGCCGAAGACCATATGGATGAAGCAAGCGGAGGAAGCCAAGTTGAAGAGCGAAGCCGAGAAGGCCGCCGCCGCCAAAGCCGCATTCGAAGCCACCTTCAATAGCAAGTCCCAACCCCAGCTGCCCCAATCCCCTTCCGCTGCGCCGTCCTCTTCCTCGGACTCCGACGACGACAATGAATCTTATGAGAAAGACTGCTCTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766237.1
MAGNNTTANSNNQVTAVPTVPKTIWMKQAEEAKLKSEAEKAAAAKAAFEATFNSKSQPQLPQSPSAAPSSSSDSDDDNESYEKDCSVGPVDPSKCTAQGAGIAGGTACVGATFAVVTKDSEGRKVARGGAQVKVRVSPGVGVGGNEQDGIVKDMGDGSYSVTYVVPKRGNYMVNVECNGKPIMGSPFPVFFSQGTPNGGLLGMAPAASYPNLVNQTMPNMPNYSGSVSGAFPGLLGMIPGVVSGASGGVVLPGMGSSLGE...

XP_057766239.1
MAGNNTTANSNNQVTAVPTVPKTIWMKQAEEAKLKSEAEKAAAAKAAFEATFNSKSQPQLPQSPSAAPSSSSDSDDDNESYEKDCSVGPVDPSKCTAQGAGIAGGTACVGATFAVVTKDSEGRKVARGGAQVKVRVSPGVGVGGNEQDGIVKDMGDGSYSVTYVVPKRGNYMVNVECNGKPIMGSPFPVFFSQGTPNGGLLGMAPAASYPNLVNQTMPNMPNYSGSVSGAFPGLLGMIPGVVSGASGGVVLPGMGSSLGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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